RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276654.9

LRP12-201, Transcript of LDL receptor related protein 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP12, Length 4,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12-201ENST00000276654 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 TEX26Q8N6G2 289 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 CNTD1Q8N815 330 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 OR13C4Q8NGS5 318 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 GNPTGQ9UJJ9 305 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 MEMO1Q9Y316 297 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 I3L1I5 382 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 INHBBP09529 407 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 CYB561P49447 251 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 POU6F1Q14863 301 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 SNX20Q7Z614 316 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 BEST3Q8N1M1 668 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 CSNK1A1LQ8N752 337 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 NRTNQ99748 197 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 CCDC77Q9BR77 488 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 ALG6Q9Y672 507 aa7.39□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 E2F3O00716 465 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 HS6ST1O60243 411 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 CD9P21926 228 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 BIVMQ86UB2 503 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 LIX1Q8N485 282 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 MAGEC3Q8TD91 643 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 TUBB6Q9BUF5 446 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 A0A1B0GTH9 108 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 E9PLN8 166 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 SLC25A12O75746 678 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 PEX11BO96011 259 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 CELA2AP08217 269 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 EFNA3P52797 238 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 OR4D2P58180 307 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 MAML1Q92585 1016 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 WDR54Q9H977 334 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 SOCS6O14544 535 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 AP2A1O95782 977 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 CAPN1P07384 714 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 KDELR1P24390 212 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 GRK3P35626 688 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 SKP1P63208 163 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 MPP3Q13368 585 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 STX1AQ16623 288 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 ACAD11Q709F0 780 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 CDCP1Q9H5V8 836 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 HYOU1Q9Y4L1 999 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.38□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 E5RI56 91 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 FCHO1O14526 889 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 NDUFS3O75489 264 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 ITGAMP11215 1152 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 SOX11P35716 441 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 RPA4Q13156 261 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 SPARCL1Q14515 664 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 SLC1A5Q15758 541 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 GPR33Q49SQ1 333 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 PALM2Q8IXS6 379 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 C18orf12Q96KH6 178 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 TEKT5Q96M29 485 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 SPSB2Q99619 263 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 DPH7Q9BTV6 452 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 DRC3Q9H069 523 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 C14orf105Q9NVL8 296 aa7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LRP12-201ENST00000276654 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms