RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRK1Q38SD2 2015 aa25.61■■□□□ 1.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 KERAO60938 352 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 CHEK2O96017 543 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 FGL2Q14314 439 aa25.6■■□□□ 1.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 CROCCQ5TZA2 2017 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 SYCE1LA8MT33 242 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 TPST1O60507 370 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 TUBB1Q9H4B7 451 aa25.59■■□□□ 1.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 CEP250Q9BV73 2442 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 SOCS5O75159 536 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJB5O75953 348 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINF2P08697 491 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ALPIP09923 528 aa25.57■■□□□ 1.68
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