RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 RNF11Q9Y3C5 154 aa22.19■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 PIPSLA2A3N6 862 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 RHPN2P1A8MT19 583 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 CLGNO14967 610 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 GNAZP19086 355 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 CATSPEREQ5SY80 951 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 CDYL2Q8N8U2 506 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 SLC5A11Q8WWX8 675 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 RSC1A1Q92681 617 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 HAUS8Q9BT25 410 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 PCBD2Q9H0N5 130 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 UCK1Q9HA47 277 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 NCDNQ9UBB6 729 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 TRAF6Q9Y4K3 522 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 TIMM22Q9Y584 194 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 GSAPA4D1B5 854 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 FAM221BA6H8Z2 402 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 LILRA5A6NI73 299 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 AZIN1O14977 448 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 EBLN1P0CF75 366 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 CDH1P12830 882 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 SERPINB3P29508 390 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 IRF8Q02556 426 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 XKR6Q5GH73 641 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 ICE2Q659A1 982 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 C17orf64Q86WR6 236 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 PHOX2BQ99453 314 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 RXFP3Q9NSD7 469 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 HRASLS2Q9NWW9 162 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 PADI4Q9UM07 663 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 BTBD3Q9Y2F9 522 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 CRCPO75575 148 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 UBXN7O94888 489 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 CLDN9O95484 217 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 CAPN1P07384 714 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 GLB1P16278 677 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 CD22P20273 847 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 VARSP26640 1264 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 DOC2AQ14183 400 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 KANK2Q63ZY3 851 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 RFWD2Q8NHY2 731 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 TWSG1Q9GZX9 223 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 ACTR10Q9NZ32 417 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 U3KQA8 63 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 WFS1O76024 890 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 FGF4P08620 206 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 ZNF883P0CG24 379 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 HGFP14210 728 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 PPP1CAP62136 330 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 SF1Q15637 639 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 OOSP2Q86WS3 158 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 CLYBLQ8N0X4 340 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 GRAMD1AQ96CP6 724 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 TRPS1Q9UHF7 1281 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 DCTN4Q9UJW0 460 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 UNC13CQ8NB66 2214 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 OR5K3A6NET4 321 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 FFAR3O14843 346 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 GPR42O15529 346 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 TGDSO95455 350 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 FAM107AO95990 144 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 JUNP05412 331 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 AMD1P17707 334 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 ALDH4A1P30038 563 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 KIR2DS3Q14952 304 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 NR0B2Q15466 257 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 NXPE4Q6UWF7 544 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 MAVSQ7Z434 540 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 ZNF438Q7Z4V0 828 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 FAM181AQ8N9Y4 354 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 L3MBTL4Q8NA19 623 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-201ENST00000222305 OR2L3Q8NG85 312 aa22.15■■□□□ 1.14
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