RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 MED13Q9UHV7 2174 aa20.86■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 A0A1B0GX78 115 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 ZBTB14O43829 449 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 MPC1LP0DKB6 136 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 OTX2P32243 289 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 UQCRFS1P47985 274 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 CCL11P51671 97 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 PNLIPRP1P54315 467 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 RRADP55042 308 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 MSS51Q4VC12 460 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 OR2A1Q8NGT9 310 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 CD200R1Q8TD46 325 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 PKP4Q99569 1192 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 NDNQ99608 321 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 TRIM55Q9BYV6 548 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 RNF14Q9UBS8 474 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 MED16Q9Y2X0 877 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 SHANK1Q9Y566 2161 aa20.85■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 A0A1W2PPV9 198 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 TTI1O43156 1089 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 CCNDBP1O95273 360 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 MCM3P25205 808 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 CARSP49589 748 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 RGS4P49798 205 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 PGDP52209 483 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 ARL4CP56559 192 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 HIF1AQ16665 826 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 PALM2Q8IXS6 379 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 ASB11Q8WXH4 323 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 CERS2Q96G23 380 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 SNF8Q96H20 258 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 IP6K3Q96PC2 410 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 DPH7Q9BTV6 452 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 CUTCQ9NTM9 273 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 TAS2R13Q9NYV9 303 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 CHMP2BQ9UQN3 213 aa20.84■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 A0A0J9YVX5 310 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 CTSVO60911 334 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 SLC16A8O95907 504 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 ERGP11308 486 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 IVDP26440 423 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 ELK3P41970 407 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 ITGA8P53708 1063 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 ATP1A4Q13733 1029 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 FAM214AQ32MH5 1076 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 C4orf17Q53FE4 359 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 MED25Q71SY5 747 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 LRRC39Q96DD0 335 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 TAC3Q9UHF0 121 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 KLK4Q9Y5K2 254 aa20.83■□□□□ 0.93
NME4-201ENST00000219479 ESPL1Q14674 2120 aa20.83■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 EFCAB8A8MWE9 144 aa20.82■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 PEX12O00623 359 aa20.82■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 NDC80O14777 642 aa20.82■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 DSCR3O14972 297 aa20.82■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 SSPNQ14714 243 aa20.82■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.82■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa20.82■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.82■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.82■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 OR2Y1Q8NGV0 311 aa20.82■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 KRT12Q99456 494 aa20.82■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa20.82■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 MYO9AB2RTY4 2548 aa20.81■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 ICE2Q659A1 982 aa20.81■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 FRMPD2BQ6IN97 320 aa20.81■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 RNF44Q7L0R7 432 aa20.81■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 ADCK2Q7Z695 626 aa20.81■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 MRGPREQ86SM8 312 aa20.81■□□□□ 0.92
NME4-201ENST00000219479 CNTN4Q8IWV2 1026 aa20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms