RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BmxP97504 651 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ZfatQ7TS63 1237 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plekhs1Q8BW88 474 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tbc1d14Q8CGA2 694 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 KptnQ8VCX6 430 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dsn1Q9CYC5 348 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hipk3Q9ERH7 1192 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mcm3apQ9WUU9 1971 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21885A0A286YDN8 145 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r50E9PW61 861 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sypl1O09117 261 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CkmP07310 381 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il1rnP25085 178 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chrm4P32211 479 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptger4P32240 513 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gdpgp1Q3TLS3 386 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Havcr1Q5QNS5 305 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bhlha9Q5RJB0 231 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defa17Q64016 82 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptx4Q6RUU0 478 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rmnd5aQ80YQ8 391 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr722Q8VFC8 308 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SharpinQ91WA6 380 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gjd3Q91YD1 278 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrps33Q9D2R8 106 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndufv2Q9D6J6 248 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcna10B2RQA1 511 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 S100zB9EJL3 99 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r114E9Q281 856 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hspa1bP17879 642 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NcanP55066 1268 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Polr2lP62876 67 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mapk1P63085 358 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zmat1Q3V0C1 714 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnajc11Q5U458 559 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adora2bQ60614 332 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ggt1Q60928 568 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Amer3Q6NS69 780 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tas2r39Q7TQA5 319 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr765Q7TRI6 309 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Amigo1Q80ZD8 492 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp20a1Q8BKE6 462 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GmppbQ8BTZ7 360 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrtm3Q8BZ81 582 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Piwil2Q8CDG1 971 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pih1d2Q8CHR9 315 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc5a9Q8VDT1 685 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr357Q8VFP4 308 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr767Q8VG33 309 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mri1Q9CQT1 369 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snx7Q9CY18 387 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CtsjQ9R014 334 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adam24Q9R160 761 aa20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myo7aP97479 2215 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tcte1A6H639 498 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp871G5E905 615 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r6H3BK29 913 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnk1O08581 336 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp21P03940 487 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptpn6P29351 595 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnj5P48545 419 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrm3Q5ND52 418 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cpa6Q5U901 438 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Jak3Q62137 1100 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sh3rf2Q8BZT2 735 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbm34Q8C5L7 375 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P3h2Q8CG71 703 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r22Q8R2D1 302 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Isoc1Q91V64 297 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clvs1Q9D4C9 354 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930578G10RikQ9D4Q4 153 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CtsrQ9JIA9 334 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CerklA2AQH1 525 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifi213D3Z5G0 586 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r90E9PXJ8 863 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Glyatl3E9Q5L8 290 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hk2O08528 917 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PtgdsO09114 189 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptch2O35595 1182 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TpmtO55060 240 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Serpina3kP07759 418 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zmym5Q3U2E2 627 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plk5Q4FZD7 595 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ablim3Q69ZX8 682 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zbtb24Q80X44 710 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stk32cQ8QZV4 488 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gtf2a1lQ8R4I4 468 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slco1a5Q91YY5 670 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ms4a10Q99N03 267 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cep97Q9CZ62 856 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem8aQ9ESN3 769 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HnrnpfQ9Z2X1 415 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zar1lC3VD30 291 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nccrp1G3X9C2 266 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cnr2P47936 347 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc1a5P51912 553 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CamkmtQ3U2J5 323 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.2 ms