RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEA1P43355 309 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RPTNQ6XPR3 784 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC22A15Q8IZD6 547 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2L8Q8NGY9 312 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 YIPF2Q9BWQ6 316 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 OSBPL8Q9BZF1 889 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC14L3Q9UDX4 400 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD12Q6UB98 2062 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 HYKKA2RU49 373 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC162PA2VCL2 907 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 WFS1O76024 890 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR35P0CG20 571 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 FBLP22087 321 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CXCR2P25025 360 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXN2P32314 431 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RBPJQ06330 500 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf63Q6NUN7 778 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFAF7Q7L592 441 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TSSK1BQ9BXA7 367 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 FITM1A5D6W6 292 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CRYABP02511 175 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVK-10P10266 1014 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 FDXRP22570 491 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CCR7P32248 378 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 SOX11P35716 441 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CASP6P55212 293 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PARP6Q2NL67 630 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC38Q502W7 563 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PRMT9Q6P2P2 845 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 VRK3Q8IV63 474 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 SUN3Q8TAQ9 357 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF285Q96NJ3 590 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MENTQ9BUN1 341 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 DOCK10Q96BY6 2186 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0J9YVX5 310 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RASGRF2O14827 1237 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CTSVO60911 334 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RASAL1O95294 804 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINA7P05543 415 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 COX6A1P12074 109 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CA7P43166 264 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD11Q693B1 232 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 FAAH2Q6GMR7 532 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 FRMPD2BQ6IN97 320 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC23LQ6PF05 361 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 UNC5DQ6UXZ4 953 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ASZ1Q8WWH4 475 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 HAS2Q92819 552 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MIPEPQ99797 713 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MED26O95402 600 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 APOA4P06727 396 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CETN2P41208 172 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 EMP2P54851 167 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TMED2Q15363 201 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ATG9BQ674R7 924 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 GSDMBQ8TAX9 411 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMF1Q92530 271 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ZUFSPQ96AP4 578 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ABI3Q9P2A4 366 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TFR2Q9UP52 801 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 EFR3BQ9Y2G0 817 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TARM1B6A8C7 271 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 FKBP9O95302 570 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 BMP10O95393 424 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL18O95568 372 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PTMAP06454 111 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MST1P26927 711 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMB5P28074 263 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 GRB7Q14451 532 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MUM1Q2TAK8 710 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 AFTPHQ6ULP2 937 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 VSTM4Q8IW00 320 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB42Q8N4Z0 105 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM71DQ8N9W8 422 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CABS1Q96KC9 395 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RIC8BQ9NVN3 520 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MROH6A6NGR9 719 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 IQCF5A8MTL0 148 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 FFAR3O14843 346 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR42O15529 346 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 TJP3O95049 919 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 WDPCPO95876 746 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 GOT2P00505 430 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 CELA2AP08217 269 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
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