RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 USP10Q14694 798 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 PDK4Q16654 411 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CACHD1Q5VU97 1274 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM92BQ6ZTR7 304 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAM1L1Q8N609 369 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC41A2Q96JW4 573 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB33BQ9H082 229 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 MLXIPLQ9NP71 852 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 POT1Q9NUX5 634 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPEQ02224 2701 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CELSR2Q9HCU4 2923 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 PIPSLA2A3N6 862 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 KMOO15229 486 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 BIRC5O15392 142 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 RASSF9O75901 435 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM107AO95990 144 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 FOLR1P15328 257 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL10P27635 214 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPRCAPQ14761 206 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 AGAP9Q5VTM2 703 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CPZQ66K79 652 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRTM4Q86VH4 590 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R3BQ86XI6 285 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 GALNT11Q8NCW6 608 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 MGARPQ8TDB4 240 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTL8Q9H568 366 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 PCMTD2Q9NV79 361 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC39A10Q9ULF5 831 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 VWA7Q9Y334 891 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A096LPK6 155 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 BUD23O43709 281 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 STMN1P16949 149 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 TTPAP49638 278 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB10P61026 200 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 TMPRSS15P98073 1019 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNG1Q06432 222 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC153Q494R4 210 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CNSTQ6PJW8 725 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM48Q8IWZ4 208 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM42Q8IWZ5 723 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 POPDC3Q9HBV1 291 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD18Q9NS91 495 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC17A7Q9P2U7 560 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 ACOT9Q9Y305 439 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 COMMD10Q9Y6G5 202 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087X1B8 175 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 PDZK1P1A8MUH7 402 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 C21orf140B9A014 251 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 BPIP17213 487 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS18P62269 152 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNAB1Q14722 419 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR33Q49SQ1 333 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 NADK2Q4G0N4 442 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM45BPQ6NSW5 357 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM45AQ8TCE6 357 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CCT8L2Q96SF2 557 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC1Q99614 292 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 FKBPLQ9UIM3 349 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 ESPL1Q14674 2120 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 AGAP14A8MT82 685 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 KLF11O14901 512 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 SEMA7AO75326 666 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 APOA4P06727 396 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNYL3P0C7X3 344 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 MC4RP32245 332 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC12A2P55011 1212 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 IL10RAQ13651 578 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT8Q16880 541 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CPT1CQ8TCG5 803 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC12Q96GR4 267 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM111AQ96PZ2 611 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 OR51F1A6NGY5 319 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL22O00626 93 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 PLIN3O60664 434 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 TAC1P20366 129 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINB4P48594 390 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC24CP53992 1094 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R39P59534 338 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CHAF1BQ13112 559 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 IRGCQ6NXR0 463 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CMC1Q7Z7K0 106 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 TAX1BP1Q86VP1 789 aa23.35■■□□□ 1.33
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