RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617185.4

TP53-222, Transcript of tumor protein p53, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene TP53, Length 2,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53-222	ENST00000617185	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185		C9JVG2	144 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185		M0R082	166 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	PGR	P06401	933 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	ANXA6	P08133	673 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	RRAS	P10301	218 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	MAOB	P27338	520 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	RAB25	P57735	213 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	OR4D2	P58180	307 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	SEMA3A	Q14563	771 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	POU4F3	Q15319	338 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	GPR19	Q15760	415 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	ZBTB6	Q15916	424 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	HKDC1	Q2TB90	917 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	CLLU1	Q5K131	121 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	WDR48	Q8TAF3	677 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	TMEM74	Q96NL1	305 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	GPR78	Q96P69	363 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	COPS3	Q9UNS2	423 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185		A0A1B0GVM2	712 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	F9	P00740	461 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	CD72	P21854	359 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	APLP1	P51693	650 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	SLC6A3	Q01959	620 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	KEAP1	Q14145	624 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	TATDN3	Q17R31	274 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	WSCD1	Q658N2	575 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	TRPV1	Q8NER1	839 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	FOPNL	Q96NB1	174 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	LRRC3	Q9BY71	257 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	PIF1	Q9H611	641 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	FBXO10	Q9UK96	956 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	INVS	Q9Y283	1065 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	HACD1	B0YJ81	288 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	GMDS	O60547	372 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	TSPAN12	O95859	305 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	PRKACG	P22612	351 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	CYP2F1	P24903	491 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	DGKQ	P52824	942 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	PGGT1B	P53609	377 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	ADIG	Q0VDE8	80 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	CRHR2	Q13324	411 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	NLRP8	Q86W28	1048 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	ENKUR	Q8TC29	256 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	ITCH	Q96J02	903 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	C3orf30	Q96M34	536 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	UROC1	Q96N76	676 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	MIOS	Q9NXC5	875 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	AASS	Q9UDR5	926 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	GABRQ	Q9UN88	632 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	FKBP7	Q9Y680	259 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TP53-222	ENST00000617185	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TP53-222	ENST00000617185	NEMP2	A6NFY4	417 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TP53-222	ENST00000617185	PTGES	O14684	152 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TP53-222	ENST00000617185	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TP53-222	ENST00000617185	ZP3	P21754	424 aa		11.27	□□□□□ -0.61

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