RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597423.1

TRIM28-209, Transcript of tripartite motif containing 28, humanhuman

TSL 3

Gene TRIM28, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28-209ENST00000597423 TBCCQ15814 346 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 XKR6Q5GH73 641 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 C17orf64Q86WR6 236 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 NAGSQ8N159 534 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 STON2Q8WXE9 905 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 REPS1Q96D71 796 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 RILPQ96NA2 401 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 IL17FQ96PD4 163 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 EHD1Q9H4M9 534 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 CAPN10Q9HC96 672 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ICKQ9UPZ9 632 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 THADAQ6YHU6 1953 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 PPP6CO00743 305 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ARHGAP33O14559 1287 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 SDC3O75056 442 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ULK1O75385 1050 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 OR4F21O95013 312 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 FKBP9O95302 570 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 CAPN1P07384 714 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 FASLGP48023 281 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 BNC1Q01954 994 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ZNF33BQ06732 778 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 NAA25Q14CX7 972 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 KANK2Q63ZY3 851 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 EPGNQ6UW88 154 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ACAD11Q709F0 780 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ARL14Q8N4G2 192 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 SLC38A3Q99624 504 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 MENTQ9BUN1 341 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 XKR8Q9H6D3 395 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 GAREM1Q9H706 876 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 TTC28Q96AY4 2481 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 KRT87PA6NCN2 255 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 RHPN2P1A8MT19 583 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ISM1B1AKI9 464 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 DIAPH2O60879 1101 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 WFS1O76024 890 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 JUPP14923 745 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 CMPK1P30085 196 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 CCT8P50990 548 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 CCR8P51685 355 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 BNIP3Q12983 259 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 IFT88Q13099 833 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 TRAF3Q13114 568 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 GPR18Q14330 331 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 C14orf28Q4W4Y0 310 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ATG9BQ674R7 924 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 CGB2Q6NT52 195 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 DDIASQ8IXT1 998 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 KRT78Q8N1N4 520 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ARL10Q8N8L6 244 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 OR6C4Q8NGE1 309 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 OR4K3Q96R72 315 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 MRGBPQ9NV56 204 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM28-209ENST00000597423 SNX7Q9UNH6 387 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms