RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 SDK1Q7Z5N4 2213 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CCT8L1PA6NM43 557 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT6AP02538 564 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT6BP04259 564 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 JUNP05412 331 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT6CP48668 564 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 TCEA2Q15560 299 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP68Q76N32 757 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 RABEPKQ7Z6M1 372 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM48Q8IWZ4 208 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CCT6BQ92526 530 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 OR6C2Q9NZP2 312 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF11Q9Y3C5 154 aa30.02■■■□□ 2.4
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CAPNS1-206ENST00000588815 SPDYAQ5MJ70 313 aa30.01■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa30.01■■■□□ 2.4
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CAPNS1-206ENST00000588815 GPR37L1O60883 481 aa30■■■□□ 2.39
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CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf61Q13536 156 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 XKR6Q5GH73 641 aa30■■■□□ 2.39
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CAPNS1-206ENST00000588815 ICKQ9UPZ9 632 aa30■■■□□ 2.39
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CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 ATG9BQ674R7 924 aa29.99■■■□□ 2.39
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CAPNS1-206ENST00000588815 RXRGP48443 463 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 NUBP1P53384 320 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
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CAPNS1-206ENST00000588815 ANGPT1Q15389 498 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 PAGE2BQ5JRK9 111 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 IL27RAQ6UWB1 636 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP29.98■■■□□ 2.395e-7■■■□□ 15.7
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