RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 JUNDP17535 347 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 PKLRP30613 574 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CASP2P42575 452 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 RAB28P51157 221 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 DOC2AQ14183 400 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 XKR6Q5GH73 641 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 Q6ZSR9 355 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 HOMEZQ8IX15 550 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 HMGCLL1Q8TB92 370 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 LRRC61Q9BV99 259 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 PFDN4Q9NQP4 134 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 ARL8BQ9NVJ2 186 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 TAAR2Q9P1P5 351 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CCL27Q9Y4X3 112 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 SPAG17Q6Q759 2223 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A1W2PPV9 198 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF839A8K0R7 811 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 VPS4BO75351 444 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 NME1P15531 152 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC19A1P41440 591 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 NXPH1P58417 271 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT33BQ14525 404 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR45BQ5MNZ6 344 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 LCTLQ6UWM7 567 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 LPCAT2Q7L5N7 544 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 TUBGCP3Q96CW5 907 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CATSPER2Q96P56 530 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 HBEGFQ99075 208 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 ICKQ9UPZ9 632 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CLGNO14967 610 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 ULK1O75385 1050 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CBX6O95503 412 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 NDUFS1P28331 727 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 TBCCQ15814 346 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 IYDQ6PHW0 289 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 SMPDL3AQ92484 453 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR34Q96EX3 536 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 MARK4Q96L34 752 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT6AP02538 564 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT6BP04259 564 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CTSEP14091 401 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT6CP48668 564 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 PRRT3Q5FWE3 981 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 GRHL2Q6ISB3 625 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM46Q7Z4K8 759 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 RAB42Q8N4Z0 105 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 XKR8Q9H6D3 395 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 DYRK1BQ9Y463 629 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 LAMA1P25391 3075 aa25.15■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 VILLO15195 856 aa25.15■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 UNC5CO95185 931 aa25.15■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 HNF4AP41235 474 aa25.15■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 OGFOD2Q6N063 350 aa25.15■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 OR2L8Q8NGY9 312 aa25.15■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 RIC8BQ9NVN3 520 aa25.15■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 SNX6Q9UNH7 406 aa25.15■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 UBDO15205 165 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 VARSP26640 1264 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 C1orf61Q13536 156 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CATSPEREQ5SY80 951 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 TAF8Q7Z7C8 310 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 TMPRSS11BQ86T26 416 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 SFRP1Q8N474 314 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 GAB3Q8WWW8 586 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC5A11Q8WWX8 675 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CXorf40BQ96DE9 158 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 HAUS8Q9BT25 410 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 EHD1Q9H4M9 534 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 PCM1Q15154 2024 aa25.14■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 H0YIV9 168 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PDYNP01213 254 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 LBPP18428 481 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 KLF10Q13118 480 aa25.13■■□□□ 1.61
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