RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	BANF1	O75531	89 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	ONECUT2	O95948	504 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGAX	P20702	1163 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CASR	P41180	1078 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	GNG11	P61952	73 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	MPP1	Q00013	466 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	TLE1	Q04724	770 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CHAF1B	Q13112	559 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	PCGF5	Q86SE9	256 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	ASB11	Q8WXH4	323 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	MIPEP	Q99797	713 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	DHRS7	Q9Y394	339 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	20.88	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	FANCG	O15287	622 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CSRP3	P50461	194 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CUL1	Q13616	776 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	MLIP	Q5VWP3	458 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNMB4	Q86W47	210 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CD200R1	Q8TD46	325 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	PKP4	Q99569	1192 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR21	Q99679	349 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	FITM1	A5D6W6	292 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	GFY	I3L273	518 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	NRP2	O60462	931 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CEACAM4	O75871	244 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC4	O95801	387 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	MPC1L	P0DKB6	136 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	MCM3	P25205	808 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	KLRB1	Q12918	225 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	TCTE1	Q5JU00	501 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	DLG3	Q92796	817 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	INPP5D	Q92835	1189 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRK2	Q5S007	2527 aa		20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GX78	115 aa		20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2A25	A4D2G3	310 aa		20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	ERVK-10	P10266	1014 aa		20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	GABRB3	P28472	473 aa		20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	ARSF	P54793	590 aa		20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF44	Q7L0R7	432 aa		20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	SMPDL3A	Q92484	453 aa		20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	NAT9	Q9BTE0	207 aa		20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	ACSS2	Q9NR19	701 aa		20.86	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPN13	Q12923	2485 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	TP73	O15350	636 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC16A8	O95907	504 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CD63	P08962	238 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	HSD17B2	P37059	387 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL11	P51671	97 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXL2	P58012	376 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNC4	Q03721	635 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP1A4	Q13733	1029 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	SSPN	Q14714	243 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	GRM7	Q14831	915 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC9A5	Q14940	896 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	MORF4L2	Q15014	288 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		20.85	■□□□□ 0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		20.85	■□□□□ 0.93

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms