RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557076.5

SCFD1-223, Transcript of sec1 family domain containing 1, human

TSL 3

Gene SCFD1, Length 743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCFD1-223	ENST00000557076	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	AGXT	P21549	392 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CMA1	P23946	247 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	EPHB2	P29323	1055 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	KRT9	P35527	623 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FLT3	P36888	993 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	RGR	P47804	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ME1	P48163	572 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SCNN1B	P51168	640 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	RENBP	P51606	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CASP6	P55212	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	AP1S1	P61966	158 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ADAM8	P78325	824 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	NCF4	Q15080	339 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	KLHL35	Q6PF15	583 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076		Q6ZPA2	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	NR4A3	Q92570	626 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PTER	Q96BW5	349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CD180	Q99467	661 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FOXB1	Q99853	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ABCG8	Q9H221	673 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TLCD2	A6NGC4	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	BECN2	A8MW95	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076		C9J4A7	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	AGPS	O00116	658 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SOCS5	O75159	536 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	UNC5C	O95185	931 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	HBQ1	P09105	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ACP5	P13686	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	IGFBP2	P18065	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	LHCGR	P22888	699 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	OTX2	P32243	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PRCP	P42785	496 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FOLH1	Q04609	750 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	RBPJ	Q06330	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	GPR18	Q14330	331 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	INA	Q16352	499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CES4A	Q5XG92	561 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TMEM198	Q66K66	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ATL3	Q6DD88	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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