RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	PSMD3	O43242	534 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	JRK	O75564	520 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	AP2A2	O94973	939 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MYBL2	P10244	700 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	UGT2B7	P16662	529 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ALAS2	P22557	587 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	NMBR	P28336	390 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MC4R	P32245	332 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ITGA8	P53708	1063 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	XIAP	P98170	497 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CDH17	Q12864	832 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MFAP5	Q13361	173 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	KIR2DS3	Q14952	304 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	INA	Q16352	499 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	HIF1A	Q16665	826 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	C8orf74	Q6P047	294 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	LINC00523	Q86TU6	105 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FJX1	Q86VR8	437 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PHC3	Q8NDX5	983 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	LRRC45	Q96CN5	670 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CNDP1	Q96KN2	507 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SERPINB12	Q96P63	405 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	OR2A14	Q96R47	310 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CDYL	Q9Y232	598 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	BSN	Q9UPA5	3926 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	DYTN	A2CJ06	578 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688		F8W8V4	182 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SOCS6	O14544	535 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PCDH17	O14917	1159 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SUN1	O94901	812 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FKBP9	O95302	570 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TPSB2	P20231	275 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FDXR	P22570	491 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ACRV1	P26436	265 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PDHA2	P29803	388 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PRKG2	Q13237	762 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SEMA3A	Q14563	771 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	GRM7	Q14831	915 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TPSAB1	Q15661	275 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZIC1	Q15915	447 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	NKG7	Q16617	165 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	BBS9	Q3SYG4	887 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MSS51	Q4VC12	460 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	VWA2	Q5GFL6	755 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TCTE1	Q5JU00	501 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	XKRX	Q6PP77	449 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RPTN	Q6XPR3	784 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36

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