RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552211.5

NCKAP1L-208, Transcript of NCK associated protein 1 like, human

TSL 5

Gene NCKAP1L, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PER3	P56645	1201 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HSF1	Q00613	529 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	CACNG1	Q06432	222 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	RPA4	Q13156	261 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PCOLCE	Q15113	449 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HOOK3	Q86VS8	718 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	BCORP1	Q8N888	145 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	AMER3	Q8N944	861 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TM9SF4	Q92544	642 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	NRGN	Q92686	78 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	WDR54	Q9H977	334 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GALP	Q9UBC7	116 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	C3orf18	Q9UK00	162 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	VPS13C	Q709C8	3753 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FITM1	A5D6W6	292 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	MROH6	A6NGR9	719 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HP	P00738	406 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PYGM	P11217	842 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ACPP	P15309	386 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	CD9	P21926	228 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SLC1A1	P43005	524 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	CA7	P43166	264 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	RAB28	P51157	221 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ARG2	P78540	354 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ART3	Q13508	389 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	KIR2DS3	Q14952	304 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TCEAL1	Q15170	157 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HKDC1	Q2TB90	917 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GPR33	Q49SQ1	333 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ODF2	Q5BJF6	829 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HDAC10	Q969S8	669 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FAM136A	Q96C01	138 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	CCDC138	Q96M89	665 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211		A0A1B0GUH1	482 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HYKK	A2RU49	373 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	KLHL33	A6NCF5	533 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	IDS	B3KWA1	339 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FOXS1	O43638	330 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GPC4	O75487	556 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ALB	P02768	609 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ETS1	P14921	441 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PSMA3	P25788	255 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SYTL3	Q4VX76	610 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PACS1	Q6VY07	963 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PLD3	Q8IV08	490 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	VSTM4	Q8IW00	320 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	MOCOS	Q96EN8	888 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	NCKAP5	O14513	1909 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NCKAP1L-208	ENST00000552211	DNHD1	Q96M86	4753 aa		9.61	□□□□□ -0.87

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