RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	KRT80	Q6KB66	452 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SPRED1	Q7Z699	444 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SVOPL	Q8N434	492 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	NATD1	Q8N6N6	113 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	RNF148	Q8N7C7	305 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	FRS2	Q8WU20	508 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	NCSTN	Q92542	709 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	UBE2E3	Q969T4	207 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM159	Q96B96	161 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	FCRL1	Q96LA6	429 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ACOX2	Q99424	681 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	EHD1	Q9H4M9	534 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF639	Q9UID6	485 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PPT2	Q9UMR5	302 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR34	Q9UPC5	381 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PDE10A	Q9Y233	779 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	IQCF5	A8MTL0	148 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442		H0YIV9	168 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CCL16	O15467	120 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PRSS23	O95084	383 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	H6PD	O95479	791 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	C1S	P09871	688 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR89B	P0CG08	455 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	G6PD	P11413	515 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CCR7	P32248	378 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	DGKG	P49619	791 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PRLHR	P49683	370 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CCT8	P50990	548 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	STARD6	P59095	220 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PRKCQ	Q04759	706 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CHRNB3	Q05901	458 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	RPA4	Q13156	261 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	LAPTM5	Q13571	262 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	KIAA0040	Q15053	153 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PDGFRL	Q15198	375 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	TEAD2	Q15562	447 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	BCL7A	Q4VC05	210 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	FRG2	Q64ET8	278 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	LAYN	Q6UX15	382 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CARM1	Q86X55	608 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	OR2T11	Q8NH01	316 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	TFAP2C	Q92754	450 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	FRG2B	Q96QU4	278 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	BOC	Q9BWV1	1114 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF839	A8K0R7	811 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	EVPLL	A8MZ36	301 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	WNT9A	O14904	365 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CLGN	O14967	610 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	INPP4B	O15327	924 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	VEGFD	O43915	354 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	DPM1	O60762	260 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	MOSPD3	O75425	235 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	GUCA1C	O95843	209 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SPATA31D3	P0C874	917 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	TIMP2	P16035	220 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	GGT1	P19440	569 aa		11.48	□□□□□ -0.57

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