RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PRV1	198 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	C19orf81	C9J6K1	198 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CSN3	P07498	182 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	STMN1	P16949	149 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	LBP	P18428	481 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CCKBR	P32239	447 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	NR4A2	P43354	598 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MMP13	P45452	471 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	LHX1	P48742	406 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC9A3	P48764	834 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPK12	P53778	367 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ASIC1	P78348	528 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PDE1B	Q01064	536 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PRKCZ	Q05513	592 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PLA2G7	Q13093	441 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAF3	Q13114	568 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PRKAA1	Q13131	559 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC39A14	Q15043	492 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	UGCG	Q16739	394 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM270	Q6UE05	265 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PGBD5	Q8N414	524 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SFRP1	Q8N474	314 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RAD54L	Q92698	747 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	FN3K	Q9H479	309 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM206	Q9H813	350 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	FZD10	Q9ULW2	581 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	NME7	Q9Y5B8	376 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0U1RQJ8	604 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PPK0	400 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SMIM30	A4D0T7	59 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5K3	A6NET4	321 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	NEMP2	A6NFY4	417 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	DVL1	O14640	695 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MID1	O15344	667 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	INSIG1	O15503	277 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RFPL2	O75678	378 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MOCS3	O95396	460 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CLDN14	O95500	239 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	OLFM2	O95897	454 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RLN1	P04808	185 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	HMOX1	P09601	288 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PLA2G4B	P0C869	781 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	HLA-DPA1	P20036	260 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CD27	P26842	260 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PSMB4	P28070	264 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308		Q0VFX4	171 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TNK1	Q13470	666 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RABEP1	Q15276	862 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TAZ	Q16635	292 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CDO1	Q16878	200 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TCTE1	Q5JU00	501 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	NRAC	Q8N912	160 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	OR7G3	Q8NG95	312 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		3.89	□□□□□ -1.79

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