RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
CLSTN3-215ENST00000544584 MATN4O95460 622 aa5.4□□□□□ -1.54
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CLSTN3-215ENST00000544584 ANXA5P08758 320 aa5.4□□□□□ -1.54
CLSTN3-215ENST00000544584 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CLSTN3-215ENST00000544584 PRKAR1AP10644 381 aa5.4□□□□□ -1.54
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CLSTN3-215ENST00000544584 APMAPQ9HDC9 416 aa5.4□□□□□ -1.54
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CLSTN3-215ENST00000544584 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PRSS56P0CW18 603 aa5.39□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CXCR2P25025 360 aa5.39□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 STX2P32856 288 aa5.39□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 PHBP35232 272 aa5.39□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ELK3P41970 407 aa5.39□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC1A2P43004 574 aa5.39□□□□□ -1.55
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