RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BOLA3Q53S33 107 aa9.66□□□□□ -0.86
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A25Q6KCM7 469 aa9.66□□□□□ -0.86
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASB8Q9H765 288 aa9.64□□□□□ -0.87
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRKCIP41743 596 aa9.63□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHRNA4P43681 627 aa9.63□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD151P48509 253 aa9.63□□□□□ -0.87
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYT16Q17RD7 645 aa9.63□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FILIP1LQ4L180 1135 aa9.63□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FLYWCH1Q4VC44 716 aa9.63□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9.63□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRMPD2BQ6IN97 320 aa9.63□□□□□ -0.87
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