RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519686.6

VNN3-212, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VNN3, Length 1,377 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-212ENST00000519686 LINC01555Q8NAE3 123 aa8.7□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.7□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 OR2L8Q8NGY9 312 aa8.7□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8.7□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.7□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.7□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 IL17FQ96PD4 163 aa8.7□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 P4HTMQ9NXG6 502 aa8.7□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 C5AR2Q9P296 337 aa8.7□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 CDC23Q9UJX2 597 aa8.7□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.7□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 FLNCQ14315 2725 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 AGPSO00116 658 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 VAPBO95292 243 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 FKBP9O95302 570 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 FGGP02679 453 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 CTSBP07858 339 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 ITGA3P26006 1051 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 CCNFP41002 786 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 GRIA3P42263 894 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 GRM7Q14831 915 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 MYBPC3Q14896 1274 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 MRNIPQ6NTE8 343 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 CNSTQ6PJW8 725 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 FIGLAQ6QHK4 219 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 ZADH2Q8N4Q0 377 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 MAGEC3Q8TD91 643 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 FKBP10Q96AY3 582 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 VPS50Q96JG6 964 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 UCN2Q96RP3 112 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 SELENOSQ9BQE4 189 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 WDR54Q9H977 334 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 LZTFL1Q9NQ48 299 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 CUTCQ9NTM9 273 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 FAM169AQ9Y6X4 670 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 MED13Q9UHV7 2174 aa8.69□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 PTPN13Q12923 2485 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 E5RI56 91 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 H3BMM5 538 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 DSCR3O14972 297 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 C1orf105O95561 183 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 CCDC175P0C221 793 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 ERVK-10P10266 1014 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 PAMP19021 973 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 ITGAXP20702 1163 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 MGAT1P26572 445 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 NMBRP28336 390 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 FMO4P31512 558 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 BDKRB1P46663 353 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 TERF1P54274 439 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 CDK16Q00536 496 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 NAA25Q14CX7 972 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 CASC4Q6P4E1 433 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 OVCH1Q7RTY7 1134 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 Q8NA96 180 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 ZUFSPQ96AP4 578 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 NACC2Q96BF6 587 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 MIPEPQ99797 713 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 MENTQ9BUN1 341 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 P2RY12Q9H244 342 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 TREX1Q9NSU2 369 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 SAMD15Q9P1V8 674 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 RELNP78509 3460 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 NBASA2RRP1 2371 aa8.68□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 TCP11X1B4DZS4 312 aa8.67□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 TARM1B6A8C7 271 aa8.67□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 GOLGA8KD6RF30 607 aa8.67□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 GOLGA8TH3BQL2 631 aa8.67□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 CEP104O60308 925 aa8.67□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 ALBP02768 609 aa8.67□□□□□ -1.02
VNN3-212ENST00000519686 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms