RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEACAM4O75871 244 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 THY1P04216 161 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 SOX3P41225 446 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 KHKP50053 298 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 IRX4P78413 519 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDK3Q00526 305 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF415Q09FC8 603 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 NR1D2Q14995 579 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM132DQ14C87 1099 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAB1Q15750 504 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSTQ16762 297 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 REG3GQ6UW15 175 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEP57L1Q8IYX8 460 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 LPAR4Q99677 370 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 PANK2Q9BZ23 570 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 WNT5BQ9H1J7 359 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 JMJD4Q9H9V9 463 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 HACL1Q9UJ83 578 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC72A6NJI9 287 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 A8MZ25 164 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM220BPB1ANY3 271 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 FPGTO14772 594 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 TEX28O15482 410 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 SH3BGRLO75368 114 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 MED24O75448 989 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT6AP02538 564 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT6BP04259 564 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 RB1P06400 928 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLTBP09497 229 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 MMP9P14780 707 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 AOC1P19801 751 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT6CP48668 564 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMF1P82094 1093 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITGA7Q13683 1181 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM182AQ5T1J6 154 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 GARNL3Q5VVW2 1013 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUDT13Q86X67 352 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 CATSPER3Q86XQ3 398 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHC2Q8IXK0 858 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 CPXCR1Q8N123 301 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR52B6Q8NGF0 335 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBC1D17Q9HA65 648 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBN1Q9NPG3 1134 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 SAGE1Q9NXZ1 904 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 LUZP4Q9P127 313 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 R4GN57 208 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1W2PR77 199 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSPAN1O60635 241 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRAMEF11O60813 436 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZWINTO95229 277 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATP1A3P13637 1013 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNFAIP3P21580 790 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTPN3P26045 913 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTGER4P35408 488 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC9A3P48764 834 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 SUOXP51687 545 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDH8P55286 799 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 RUNX3Q13761 415 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATAD3CQ5T2N8 411 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 LEKR1Q6ZMV7 388 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM205AQ6ZU69 1335 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGAP11Q8TF27 550 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 NSMAFQ92636 917 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 C2orf48Q96LS8 159 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIFC3Q9BVG8 833 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF541Q9H0D2 1346 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDFQ9HBH1 243 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 SELENOKQ9Y6D0 94 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIAS3Q9Y6X2 628 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 FRMD3A2A2Y4 597 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 G3V2L1 256 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 K7EQD1 137 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR2T7P0C7T2 308 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 GABRB1P18505 474 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATP4BP51164 291 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNA2P51530 1060 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYL7Q01449 175 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 CRYMQ14894 314 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF79Q15937 498 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPECC1Q5M775 1068 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 C11orf63Q6NUN7 778 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRR22Q8IZ63 422 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXO39Q8N4B4 442 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 BADQ92934 168 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms