RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 ANKRD63C9JTQ0 380 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAP2K7O14733 419 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 SURF4O15260 269 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 EMC8O43402 210 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF253O75346 499 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
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RNU6-162P-201ENST00000516228 STBD1O95210 358 aa-0.23□□□□□ -2.45
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RNU6-162P-201ENST00000516228 DCDC1P59894 354 aa-0.23□□□□□ -2.45
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RNU6-162P-201ENST00000516228 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP-0.23□□□□□ -2.45
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RNU6-162P-201ENST00000516228 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 RASGEF1CQ8N431 466 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF615Q8N8J6 731 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 STYXQ8WUJ0 223 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC17A9Q9BYT1 436 aa-0.23□□□□□ -2.45
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RNU6-162P-201ENST00000516228 C20orf141Q9NUB4 165 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 AQP12BA6NM10 295 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 TO15178 435 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 JRKO75564 520 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 RHBDL1O75783 438 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCR3P51677 355 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 PNLIPRP1P54315 467 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 EFNB1P98172 346 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF667Q5HYK9 610 aa-0.24□□□□□ -2.45
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RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM81Q6P7N7 255 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 RRAGAQ7L523 313 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPAINQ86UA6 219 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 TCEAL8Q8IYN2 117 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPC2Q8N158 579 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAGEB6Q8N7X4 407 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIF1BPQ96EK5 621 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM68Q96MH6 324 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 NUP85Q9BW27 656 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 VN1R1Q9GZP7 353 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa-0.24□□□□□ -2.45
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RNU6-162P-201ENST00000516228 HCN3Q9P1Z3 774 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 DERAQ9Y315 318 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
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RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A1W2PPK0 400 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 GOLGA6CA6NDK9 693 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 GOLGA6BA6NDN3 693 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 F8VVB4 439 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 F8VWA3 439 aa-0.25□□□□□ -2.45
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RNU6-162P-201ENST00000516228 DCNP07585 359 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 GOLGA6DP0CG33 693 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 ADORA3P0DMS8 318 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 CELP19835 753 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 NUDT1P36639 197 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 GNAQP50148 359 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 P2RY4P51582 365 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC25A1P53007 311 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDC16Q13042 620 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRKAA1Q13131 559 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 SQLEQ14534 574 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 GRM3Q14832 879 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 IL17AQ16552 155 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 IQCCQ4KMZ1 466 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC25A53Q5H9E4 307 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 AGAP6Q5VW22 663 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC00336Q6ZUF6 198 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC190Q86UF4 302 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 SYTL1Q8IYJ3 562 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa-0.25□□□□□ -2.45
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