RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC2A11Q9BYW1 496 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTMR12Q9C0I1 747 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PFDN4Q9NQP4 134 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 MDFICQ9P1T7 246 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRID1Q9ULK0 1009 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 STUB1Q9UNE7 303 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMED3Q9Y3Q3 217 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 STK36Q9NRP7 1315 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 C2CD4DB7Z1M9 353 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 HHLA1C9JL84 531 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLCO1B7G3V0H7 640 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF197O14709 1029 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 LINC01565O15544 149 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRID2O43424 1007 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GLRA3O75311 464 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDK2AP2O75956 126 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 DDHD2O94830 711 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 HSPA4LO95757 839 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PENKP01210 267 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 VTNP04004 478 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 FDPSP14324 419 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 HOXC13P31276 330 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 HSPA4P34932 840 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 HSD17B3P37058 310 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GP5P40197 560 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAGEA11P43364 429 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPL21P46778 160 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNJ10P78508 379 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GCNT1Q02742 428 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PHKG1Q16816 387 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 UGP2Q16851 508 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TCTE1Q5JU00 501 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GFI1BQ5VTD9 330 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR4A47Q6IF82 309 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF790Q6PG37 636 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRAT1Q6PIZ9 186 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SH2D5Q6ZV89 423 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRT77Q7Z794 578 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 VSIG1Q86XK7 387 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIRREL3Q8IZU9 778 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 LSMEM2Q8N112 164 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 IQUBQ8NA54 791 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR2T11Q8NH01 316 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR4C3Q8NH37 302 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 DYRK2Q92630 601 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SIPA1Q96FS4 1042 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRR1Q96L50 414 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPATA33Q96N06 139 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 KATNB1Q9BVA0 655 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZMYND12Q9H0C1 365 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 FN3KQ9H479 309 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 P4HTMQ9NXG6 502 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TXNDC16Q9P2K2 825 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 POLLQ9UGP5 575 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNX7Q9UNH6 387 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARID2Q68CP9 1835 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A087X002 238 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSPY2A6NKD2 308 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 NR5A2O00482 541 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PSMD14O00487 310 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNX3O60493 162 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TBCAO75347 108 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GSRP00390 522 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 APOHP02749 345 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAF1P04049 648 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADRA2CP18825 462 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CD27P26842 260 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAP2K2P36507 400 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPY4RP50391 375 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GSDMDP57764 484 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ROR1Q01973 937 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 MZT1Q08AG7 82 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TUBB2AQ13885 445 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTGISQ16647 500 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 UGCGQ16739 394 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC25A53Q5H9E4 307 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SUSD4Q5VX71 490 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 UGT3A1Q6NUS8 523 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADAM5Q6NVV9 412 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms