RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TLR10	Q9BXR5	811 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ASB8	Q9H765	288 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	NPHS2	Q9NP85	383 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM140	Q9NV12	185 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CMTM6	Q9NX76	183 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TINAG	Q9UJW2	476 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PADI3	Q9ULW8	664 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1W2PQ09	198 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	BTBD17	A6NE02	478 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CBY3	A6NI87	242 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM170B	A6NMN3	283 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PTGES	O14684	152 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	INSIG1	O15503	277 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	DNAJB6	O75190	326 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ECI2	O75521	394 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SASH3	O75995	380 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	HTR3B	O95264	441 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SNAP29	O95721	258 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CALB1	P05937	261 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TUBB	P07437	444 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	STS	P08842	583 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	STAG3L2	P0CL84	134 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SRC	P12931	536 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	BRAF	P15056	766 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ATF2	P15336	505 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MMP8	P22894	467 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PTPN3	P26045	913 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SERPINB1	P30740	379 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	OTX2	P32243	289 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PAFAH1B1	P43034	410 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TAF6	P49848	677 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM189B	P81408	668 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	REEP5	Q00765	189 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	DSG1	Q02413	1049 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CLC	Q05315	142 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF33A	Q06730	810 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PTP4A2	Q12974	167 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SMCO1	Q147U7	214 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	BCL7A	Q4VC05	210 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	EOGT	Q5NDL2	527 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	KCTD11	Q693B1	232 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	VIT	Q6UXI7	678 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MON1B	Q7L1V2	547 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	NXPE1	Q8N323	547 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	OR2L3	Q8NG85	312 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	OR52N1	Q8NH53	320 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PHF21A	Q96BD5	680 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PBK	Q96KB5	322 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SDCBP2	Q9H190	292 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ACP6	Q9NPH0	428 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	RGS18	Q9NS28	235 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MID2	Q9UJV3	735 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	AMFR	Q9UKV5	643 aa		6.6	□□□□□ -1.35

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