RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 TSNQ15631 228 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 PPP1R3AQ16821 1122 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 TMTC4Q5T4D3 741 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 MROH9Q5TGP6 573 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 FCRL6Q6DN72 434 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 CEACAM20Q6UY09 585 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 SYTL1Q8IYJ3 562 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ZNF248Q8NDW4 579 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 OR2L3Q8NG85 312 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 MCOLN3Q8TDD5 553 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 SMPDL3AQ92484 453 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 SLC22A18Q96BI1 424 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 CCDC138Q96M89 665 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 PAFAH2Q99487 392 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 MIPEPQ99797 713 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ACAT2Q9BWD1 397 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 SPRY4Q9C004 299 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 B3GNT4Q9C0J1 378 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 DERL2Q9GZP9 239 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ATG10Q9H0Y0 220 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 PDE7BQ9NP56 450 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 FGF21Q9NSA1 209 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ABCF3Q9NUQ8 709 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 TAC3Q9UHF0 121 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 RARRES3Q9UL19 164 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ZNF839A8K0R7 811 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 STK17BO94768 372 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 KIAA0754O94854 1291 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 GUCA1CO95843 209 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 DLGAP3O95886 979 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 INHBAP08476 426 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 CCDC166P0CW27 439 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 LIPCP11150 499 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 HIST1H2ADP20671 130 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 CD82P27701 267 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ITPKBP27987 946 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 GCAP28676 217 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 HSD17B2P37059 387 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 GRIA3P42263 894 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 MSH2P43246 934 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 CSRP3P50461 194 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 TBPL1P62380 186 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 TUBB4BP68371 445 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 IRF9Q00978 393 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 CSHL1Q14406 222 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 SLC29A2Q14542 456 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 IL11RAQ14626 422 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 FIGLAQ6QHK4 219 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 AGTRAPQ6RW13 159 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 RAPH1Q70E73 1250 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 PPP1R3BQ86XI6 285 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 DTX1Q86Y01 620 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 DNAJC22Q8N4W6 341 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 OR1L3Q8NH93 324 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ANKRD7Q92527 254 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 PTERQ96BW5 349 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 MED8Q96G25 268 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 TCTN2Q96GX1 697 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 UBXN10Q96LJ8 280 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 HIST1H2AJQ99878 128 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 H2AFJQ9BTM1 129 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 SNX15Q9NRS6 342 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ARL15Q9NXU5 204 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 A0A087WV48 116 aa8.31□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa8.31□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms