RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 OAS2P29728 719 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ALDH3A1P30838 453 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GMPRP36959 345 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 BDKRB1P46663 353 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SLC6A12P48065 614 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 WDR4P57081 412 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GPLD1P80108 840 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PCDH1Q08174 1060 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SQSTM1Q13501 440 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 KIR2DS3Q14952 304 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SYTL1Q8IYJ3 562 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CARFQ8N187 725 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ZNF480Q8WV37 535 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 DYDC1Q8WWB3 177 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB9Q96C00 473 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CRELD1Q96HD1 420 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CNDP1Q96KN2 507 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SLC38A3Q99624 504 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 DPYSL5Q9BPU6 564 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 HAUS8Q9BT25 410 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 MENTQ9BUN1 341 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SGPP1Q9BX95 441 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 RAB33BQ9H082 229 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SRMSQ9H3Y6 488 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GPRC5BQ9NZH0 403 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 LRIT1Q9P2V4 623 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 OPTCQ9UBM4 332 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TMEM114B3SHH9 223 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 E7ENX8 843 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CBFA2T3O75081 653 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 MLYCDO95822 493 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SERPINE1P05121 402 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 RPS17P08708 135 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CKMT1AP12532 417 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ABATP80404 500 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TAP2Q03519 686 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PRKAA1Q13131 559 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PRKG2Q13237 762 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GPR18Q14330 331 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PLCL1Q15111 1095 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PDK4Q16654 411 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PROX2Q3B8N5 592 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CFAP157Q5JU67 520 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ZNF678Q5SXM1 525 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 LCTLQ6UWM7 567 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 RGS9BPQ6ZS82 235 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 OOSP2Q86WS3 158 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GATAD2AQ86YP4 633 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 C10orf107Q8IVU9 208 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SLC35F3Q8IY50 421 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 KYQ8NBH2 561 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 OR6Y1Q8NGX8 325 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 WDR48Q8TAF3 677 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PPP4R1Q8TF05 950 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 EXT2Q93063 718 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PHF21BQ96EK2 531 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 APOLD1Q96LR9 279 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CDC6Q99741 560 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 OGFRQ9NZT2 677 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 EPHA6Q9UF33 1036 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 KCNE2Q9Y6J6 123 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PTPRBP23467 1997 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PIPSLA2A3N6 862 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 C2orf74A8MZ97 194 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TRIM38O00635 465 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PPM1DO15297 605 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TAPBPO15533 448 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SIGLEC6O43699 453 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 UGDHO60701 494 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GP1BAP07359 652 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 EPB42P16452 691 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CKMT2P17540 419 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 NAGLUP54802 743 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CYP4F3Q08477 520 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 NAE1Q13564 534 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TCEA2Q15560 299 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PTCHD3Q3KNS1 767 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CCSMST1Q4G0I0 132 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CCDC157Q569K6 752 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ARMC6Q6NXE6 501 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 EID2Q8N6I1 236 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 OR10G6Q8NH81 332 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 MGARPQ8TDB4 240 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms