RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 PLXDC2Q6UX71 529 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 DLEU7Q6UYE1 221 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 GBGT1Q8N5D6 347 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM216AQ8WUB2 273 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 THRSPQ92748 146 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 SLCO4A1Q96BD0 722 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 LINGO1Q96FE5 620 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ASCL2Q99929 193 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 CARD6Q9BX69 1037 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 Q9H8V8 135 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 FZD3Q9NPG1 666 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 HPCAL4Q9UM19 191 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF510Q9Y2H8 683 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 TMED3Q9Y3Q3 217 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 MACROD2A1Z1Q3 448 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5K3A6NET4 321 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 CASTOR2A6NHX0 329 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 C15orf62A8K5M9 175 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 F8WDY8 70 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V1G1O75348 118 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 SCGB2A1O75556 95 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 PALMO75781 387 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 OPN1MWP04001 364 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 OPN1MW2P0DN77 364 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 OPN1MW3P0DN78 364 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF18P17022 549 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGAP25P42331 645 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 SULT2A1Q06520 285 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 DSC1Q08554 894 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 SPP2Q13103 211 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 MTX1Q13505 466 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 CA9Q16790 459 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP78Q5JTW2 689 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6ZPA2 131 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF627Q7L945 461 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 AMZ2Q86W34 360 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 LAX1Q8IWV1 398 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF34Q8IZ26 560 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 C7orf57Q8NEG2 295 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 LPAR1Q92633 364 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 TXNDC15Q96J42 360 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ANP32EQ9BTT0 268 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC39A8Q9C0K1 460 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 LRMDAQ9H2I8 198 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ECT2Q9H8V3 914 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDH9Q9HC56 1237 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ACKR4Q9NPB9 350 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 CENPMQ9NSP4 180 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNJ14Q9UNX9 436 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 PLA2G4CQ9UP65 541 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR37Q9Y2I8 494 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD66B4E2M5 251 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM150CB9EJG8 249 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 VWA5AO00534 786 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 SNX3O60493 162 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 C1QL1O75973 258 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP1A2P05177 515 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 MMP10P09238 476 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 SP9P0CG40 484 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 PDHBP11177 359 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 FUT1P19526 365 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 PITPNBP48739 271 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 TDO2P48775 406 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 IL10RBQ08334 325 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAF1Q13077 416 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 SGCGQ13326 291 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 RAPSNQ13702 412 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 RBBP7Q16576 425 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 AGAP6Q5VW22 663 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ARMCX2Q7L311 632 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 NPEPL1Q8NDH3 523 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 OR56B1Q8NGI3 324 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF128Q8TEB7 428 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGAP45Q92619 1136 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 PIGTQ969N2 578 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 PHF21AQ96BD5 680 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 PGM2Q96G03 612 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ERP44Q9BS26 406 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 VN1R1Q9GZP7 353 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS33BQ9H267 617 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms