RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 RECKO95980 971 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 AHSGP02765 367 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 PTPN4P29074 926 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CARSP49589 748 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 RPS15P62841 145 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CALCOCO2Q13137 446 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CBLBQ13191 982 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ARHGAP19Q14CB8 494 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 C16orf46Q6P387 395 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKMY2Q8IV38 441 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CPNE9Q8IYJ1 553 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SYTL1Q8IYJ3 562 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 NDNQ99608 321 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 MIPEPQ99797 713 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CHST8Q9H2A9 424 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TAS2R13Q9NYV9 303 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 WHRNQ9P202 907 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC17A6Q9P2U8 582 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TARM1B6A8C7 271 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 GFYI3L273 518 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 MCM3P25205 808 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 PSMB5P28074 263 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 HSD17B2P37059 387 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 GRIA3P42263 894 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CCR10P46092 362 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TLE1Q04724 770 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ERV3-1Q14264 604 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 FCRL6Q6DN72 434 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TLDC1Q6P9B6 456 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 FIGLAQ6QHK4 219 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CYHR1Q6ZMK1 362 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SPNS2Q8IVW8 549 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 FBXO36Q8NEA4 188 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 OR2L3Q8NG85 312 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 OR2A1Q8NGT9 310 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SMPDL3AQ92484 453 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SEC14L1Q92503 715 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ZUFSPQ96AP4 578 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 RUFY1Q96T51 708 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 PKP4Q99569 1192 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ADNPQ9H2P0 1102 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 DPH5Q9H2P9 285 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 EURLQ9NYK6 297 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKMY1Q9P2S6 941 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SRPK3Q9UPE1 567 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 KLK4Q9Y5K2 254 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF839A8K0R7 811 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ZBTB14O43829 449 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC16A8O95907 504 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CTSBP07858 339 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 RAB40ALP0C0E4 278 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SFTPCP11686 197 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 RGS4P49798 205 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PNLIPRP1P54315 467 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CDKN2DP55273 166 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 POLE2P56282 527 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 RPS18P62269 152 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 MGAT5Q09328 741 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 NAA25Q14CX7 972 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 DEFB109BQ30KR1 87 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PTCHD3Q3KNS1 767 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 DUPD1Q68J44 220 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 LCN10Q6JVE6 187 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 RHBDD2Q6NTF9 364 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM198BQ6UWH4 519 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SYVN1Q86TM6 617 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ZBED8Q8IZ13 594 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PROKR1Q8TCW9 393 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 NLNQ9BYT8 704 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 IRAK4Q9NWZ3 460 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ZFATQ9P243 1243 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 POLHQ9Y253 713 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD12Q6UB98 2062 aa13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms