RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 BBS12Q6ZW61 710 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CRYBG2Q8N1P7 616 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 C8orf58Q8NAV2 365 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ATG4AQ8WYN0 398 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 COPS5Q92905 334 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 AP5M1Q9H0R1 490 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MMP28Q9H239 520 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SLC38A1Q9H2H9 487 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 C6orf50Q9HD87 102 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM161AQ9NX61 479 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM216Q9P0N5 145 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 A0A087X0T9 212 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0D9SFI3 127 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MROH6A6NGR9 719 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF487B1APH4 448 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 UBDO15205 165 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TLL1O43897 1013 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 F10P00742 488 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM253P0C7T8 217 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 IFNGR1P15260 489 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ACVR2AP27037 513 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ACTR1AP61163 376 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 DUSP4Q13115 394 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB6Q15916 424 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MGAT5BQ3V5L5 792 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GLYATQ6IB77 296 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 DEGS2Q6QHC5 323 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SMARCD3Q6STE5 483 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 SIRT2Q8IXJ6 389 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FBXO22Q8NEZ5 403 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OR2AP1Q8NGE2 309 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SLC22A17Q8WUG5 538 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RNF34Q969K3 372 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MARVELD3Q96A59 401 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 ELMOD3Q96FG2 381 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 QRFPRQ96P65 431 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PKP4Q99569 1192 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TTYH3Q9C0H2 523 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FAM118AQ9NWS6 357 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 COMMD3Q9UBI1 195 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A14Q9UN76 642 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ABCC5O15440 1437 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0A6YYJ9 748 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 UGT2B11O75310 529 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TOX4O94842 621 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 S100A7P31151 101 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 SOX9P48436 509 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FMO5P49326 533 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LIMK2P53671 638 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PRRX1P54821 245 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CDH18Q13634 790 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NFIXQ14938 502 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 UBXN2BQ14CS0 331 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SLC1A5Q15758 541 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LIPJQ5W064 366 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OR6B2Q6IFH4 312 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CHSY1Q86X52 802 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF619Q8N2I2 560 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 KDM8Q8N371 416 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MTURNQ8N3F0 131 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MYCT1Q8N699 235 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TSPAN17Q96FV3 270 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 MINPP1Q9UNW1 487 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 BCKDKO14874 412 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 DFFBO76075 338 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 C2P06681 752 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PRF1P14222 555 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CPB1P15086 417 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RAB6AP20340 208 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SSTR2P30874 369 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HCAR3P49019 387 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GPR15P49685 360 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 KLK7P49862 253 aa5.47□□□□□ -1.53
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