RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 FUT4P22083 530 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 AIF1P55008 147 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 RAB25P57735 213 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 LRRC73Q5JTD7 316 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 MPP7Q5T2T1 576 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 HECTD2Q5U5R9 776 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ANXA8L1Q5VT79 327 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 GLYATQ6IB77 296 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 LIN54Q6MZP7 749 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 FAM131AQ6UXB0 335 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 THAP5Q7Z6K1 395 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CDH26Q8IXH8 852 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 HS6ST2Q96MM7 605 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ENPP3O14638 875 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CBX5P45973 191 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 GPR158Q5T848 1215 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 FAM91A1Q658Y4 838 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 OR4L1Q8NH43 312 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SPATA22Q8NHS9 363 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 C5orf34Q96MH7 638 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PPM1MQ96MI6 270 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 RASSF1Q9NS23 344 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SIRPGQ9P1W8 387 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 IKZF2Q9UKS7 526 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 HIF3AQ9Y2N7 669 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TTLL8A6PVC2 850 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CSTAP01040 98 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ASLP04424 464 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 F7P08709 466 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 NT5EP21589 574 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ICAM3P32942 547 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 LIPEQ05469 1076 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 MBTD1Q05BQ5 628 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 RAB30Q15771 203 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ZFP69Q49AA0 526 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 OR2T12Q8NG77 320 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 OR8H1Q8NGG4 311 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SEMA4CQ9C0C4 833 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TRPS1Q9UHF7 1281 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SLC22A2O15244 555 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PRKCHP24723 683 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 IL18Q14116 193 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 FGL2Q14314 439 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 USP41Q3LFD5 358 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TICAM1Q8IUC6 712 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SLC34A3Q8N130 599 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TWIST2Q8WVJ9 160 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 DNASE1L2Q92874 299 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 BIN3Q9NQY0 253 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 IFT52Q9Y366 437 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 DHRS7Q9Y394 339 aa11.35□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 HOXC6P09630 235 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CDK18Q07002 472 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 MBLAC2Q68D91 279 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 KCTD8Q6ZWB6 473 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 GPR142Q7Z601 462 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SMPDL3BQ92485 455 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ITCHQ96J02 903 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 GPR20Q99678 358 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PKP2Q99959 881 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SNTG1Q9NSN8 517 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 OXSMQ9NWU1 459 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 URADA6NGE7 173 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 MAGEB3O15480 346 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF432O94892 652 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 STBD1O95210 358 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SLC6A2P23975 617 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 L1CAMP32004 1257 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CDH15P55291 814 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 DUSP4Q13115 394 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 OR52J3Q8NH60 311 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ASB9Q96DX5 294 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PPP3R2Q96LZ3 170 aa11.34□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TWNKQ96RR1 684 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms