RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 NACA2Q9H009 215 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 KCNH6Q9H252 994 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 A0A096LPI6 279 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 WNT9AO14904 365 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PRKCDQ05655 676 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ABHD18Q0P651 414 aa14.55□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 AMER2Q8N7J2 671 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 MGME1Q9BQP7 344 aa14.55□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 RASSF1Q9NS23 344 aa14.55□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 A0A0D9SEW6 157 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 HAT1O14929 419 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CCNDBP1O95273 360 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PGLSO95336 258 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF682O95780 498 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 LPOP22079 712 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 GGT5P36269 586 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CTSKP43235 329 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 MAPKAPK2P49137 400 aa14.55□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 HMGCS1Q01581 520 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 METTL4Q8N3J2 472 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ATL1Q8WXF7 558 aa14.55□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 KRT84Q9NSB2 600 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 RNF6Q9Y252 685 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.55□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PLXNA3P51805 1871 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 FFAR3O14843 346 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 GPR42O15529 346 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 FFAR2O15552 330 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TLR5O60602 858 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ESR1P03372 595 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 EPHA2P29317 976 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 S100A5P33763 92 aa14.54□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC103Q8IW40 242 aa14.54□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 EXOC2Q96KP1 924 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SERHLQ9NQF3 203 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 KRT75O95678 551 aa14.54□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 GADD45AP24522 165 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PIK3CGP48736 1102 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 HSPA7P48741 367 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 OR7D4Q8NG98 312 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 APH1BQ8WW43 257 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.54□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 IQCF5A8MTL0 148 aa14.53□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 M0R082 166 aa14.53□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 DSCR3O14972 297 aa14.53□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHGA12O60330 932 aa14.53□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 WDR47O94967 919 aa14.53□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 NKX3-2P78367 333 aa14.53□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.53□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 HORMAD1Q86X24 394 aa14.53□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.53□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ELMOD1Q8N336 334 aa14.53□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.53□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 UBE2FQ969M7 185 aa14.53□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SMIM14Q96QK8 99 aa14.53□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 MYOCQ99972 504 aa14.53□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.53□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.53□□□□□ -0.08
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