RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOA4P06727 396 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACPPP15309 386 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLC1Q07866 573 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEMA3AQ14563 771 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM214AQ32MH5 1076 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSTD2Q5T7W7 516 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF534Q76KX8 674 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CATSPER1Q8NEC5 780 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4L1Q8NH43 312 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35B2Q8TB61 432 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZUFSPQ96AP4 578 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOCOSQ96EN8 888 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LMF1Q96S06 567 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM121Q9BTD3 319 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CARD6Q9BX69 1037 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF160Q9HCG1 818 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIMKLBQ9ULI2 386 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP10Q9Y6W6 482 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APCP25054 2843 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTOGQ6ZRI0 2925 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IQCF5A8MTL0 148 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TARM1B6A8C7 271 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTSVO60911 334 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JRKO75564 520 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED26O95402 600 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAS8O95995 478 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TDGF1P3P51864 188 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARG2P78540 354 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OCA2Q04671 838 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACVR1Q04771 509 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMED2Q15363 201 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WASHC2DQ5SRD0 308 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC57Q8N9N7 239 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1N1Q8NGS0 311 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STT3BQ8TCJ2 826 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIEF2Q96C03 454 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPY26PQ9H489 355 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF304Q9HCX3 659 aa12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HYKKA2RU49 373 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRID2IPA4D2P6 1211 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOWAHDA6NJG2 315 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTNL10A8MVZ5 291 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRP2O60462 931 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP1O94782 785 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLCO2B1O94956 709 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZGLP1P0C6A0 271 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AOAHP28039 575 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMB5P28074 263 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOX11P35716 441 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BDKRB1P46663 353 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEP78395 509 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INAQ16352 499 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRMPD2BQ6IN97 320 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRMT9Q6P2P2 845 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC23LQ6PF05 361 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF44Q7L0R7 432 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KBTBD2Q8IY47 623 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS58Q8IYP2 241 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT222Q8N1A0 295 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6P1Q8NGX9 317 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR4A3Q92570 626 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C8orf44Q96CB5 159 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF778Q96MU6 729 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIPEPQ99797 713 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COPG2Q9UBF2 871 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C3orf18Q9UK00 162 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLK4Q9Y5K2 254 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKAP9Q99996 3911 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa12.57□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa12.56□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV17A0A0B4J275 112 aa12.56□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0J9YVX5 310 aa12.56□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYTNA2CJ06 578 aa12.56□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDH17O14917 1159 aa12.56□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUN1O94901 812 aa12.56□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX6A1P12074 109 aa12.56□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBLP22087 321 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FDXRP22570 491 aa12.56□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADRA1DP25100 572 aa12.56□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNK10P57789 538 aa12.56□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATG9BQ674R7 924 aa12.56□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa12.56□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms