RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 OR2L3Q8NG85 312 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 KCNE4Q8WWG9 221 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ARL15Q9NXU5 204 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 TIAF1O95411 115 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 GUCA1CO95843 209 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF28P17035 718 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 CD82P27701 267 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 TGIF1Q15583 401 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ANKRD7Q92527 254 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM54Q9BYV2 358 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 DERL2Q9GZP9 239 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ATG10Q9H0Y0 220 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 WDR70Q9NW82 654 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 TAC3Q9UHF0 121 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.96■■□□□ 1.27
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UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM150CB9EJG8 249 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 STMND1H3BQB6 276 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 RRP8O43159 456 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 HCRTR1O43613 425 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC35E2BP0CK96 405 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 VSNL1P62760 191 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 CSHL1Q14406 222 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 TSNQ15631 228 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 PPP1R3AQ16821 1122 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 DEFB110Q30KQ9 67 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 FCRL6Q6DN72 434 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 FIGLAQ6QHK4 219 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 ULBP3Q9BZM4 244 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 STK17BO94768 372 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 LIPCP11150 499 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 CRABP2P29373 138 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 GRIA3P42263 894 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 MSH2P43246 934 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 CLN3Q13286 438 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC29A2Q14542 456 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 AGTRAPQ6RW13 159 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 UBXN10Q96LJ8 280 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 SPRY4Q9C004 299 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 FANCEQ9HB96 536 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 PILRAQ9UKJ1 303 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 SPTBP11277 2137 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 A0A087WV48 116 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 KLK10O43240 276 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 FKBP9O95302 570 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 CD1DP15813 335 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 CMPK1P30085 196 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 AP1S2P56377 157 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 TBPL1P62380 186 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 DTX1Q86Y01 620 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 OR1L3Q8NH93 324 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 MED8Q96G25 268 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC6A20Q9NP91 592 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 SNX15Q9NRS6 342 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 DSPP15924 2871 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 NRP2O60462 931 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 KIAA0754O94854 1291 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 MSL3P1P0C860 447 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 ITPKBP27987 946 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 GABRA4P48169 554 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 DLG1Q12959 904 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 NAE1Q13564 534 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 ICE2Q659A1 982 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 SPACA3Q8IXA5 215 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 DNAJC22Q8N4W6 341 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 OARD1Q9Y530 152 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 C2P06681 752 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 GCAP28676 217 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 SERPINB9P50453 376 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-202ENST00000410062 FRA10AC1Q70Z53 315 aa22.92■■□□□ 1.26
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