RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 CAPN3P20807 821 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ME2P23368 584 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 DPTQ07507 201 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ABRQ12979 859 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 GTF2H3Q13889 308 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CEACAM7Q14002 265 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 GNA13Q14344 377 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PYDC1Q8WXC3 89 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PYCR2Q96C36 320 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CIB1Q99828 191 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 BRINP2Q9C0B6 783 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 NUMA1Q14980 2115 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 F5P12259 2224 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGEF33A8MVX0 844 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 E7ENX8 843 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ARNTLO00327 626 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 MID1O15344 667 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 RGS14O43566 566 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ULK1O75385 1050 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ANPEPP15144 967 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PRKACAP17612 351 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC6A12P48065 614 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SEC13P55735 322 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 KCNK10P57789 538 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 GRIK2Q13002 908 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 FLOT2Q14254 428 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CST6Q15828 149 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SGO1Q5FBB7 561 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 AAGABQ6PD74 315 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 HACD2Q6Y1H2 254 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 NLRP8Q86W28 1048 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CADM3Q8N126 398 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ROPN1LQ96C74 230 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC45A3Q96JT2 553 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC29A3Q9BZD2 475 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 S100A14Q9HCY8 104 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SPAG4Q9NPE6 437 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 NDUFAF1Q9Y375 327 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 NVLO15381 856 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC22A3O75751 556 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 BAG2O95816 211 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CATP04040 527 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CTRB1P17538 263 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 EPORP19235 508 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ITPKAP23677 461 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 DRD3P35462 400 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 VHLP40337 213 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 MTHFRP42898 656 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 HAAOP46952 286 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 UFM1P61960 85 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 EMX2Q04743 252 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 RCAN2Q14206 197 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 IMPG1Q17R60 797 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 BCL7AQ4VC05 210 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 MTSS1LQ765P7 747 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 RETREG3Q86VR2 466 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC22A15Q8IZD6 547 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 FOPNLQ96NB1 174 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCG4Q9H172 646 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 DNAJC11Q9NVH1 559 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 NMRK1Q9NWW6 199 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ZIM2Q9NZV7 527 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms