RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396308.3

VAMP1-202, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene VAMP1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1-202ENST00000396308 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 XKR6Q5GH73 641 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 LIPJQ5W064 366 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SFRP1Q8N474 314 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 METTL6Q8TCB7 284 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SLC37A2Q8TED4 501 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 REPS1Q96D71 796 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 IL17FQ96PD4 163 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SDC3O75056 442 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 VPS4BO75351 444 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CAPN1P07384 714 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 HNF4AP41235 474 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 RXRGP48443 463 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CCT8P50990 548 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PHEXP78562 749 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 GRIK2Q13002 908 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 IFT88Q13099 833 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CHIT1Q13231 466 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 LAPTM5Q13571 262 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 NAA25Q14CX7 972 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 KLHL35Q6PF15 583 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 C10orf82Q8WW14 230 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 STON2Q8WXE9 905 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 UBE2E3Q969T4 207 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 C19orf60Q96EN9 201 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PRRX2Q99811 253 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 NUF2Q9BZD4 464 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 TMEM74BQ9NUR3 256 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 TAC3Q9UHF0 121 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ICKQ9UPZ9 632 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.91□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 TMEM233B4DJY2 109 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 YY2O15391 372 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CXCR2P25025 360 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CMPK1P30085 196 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 GPR18Q14330 331 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ZNF423Q2M1K9 1284 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 NXNQ6DKJ4 435 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 NAGSQ8N159 534 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 KRT78Q8N1N4 520 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CDK15Q96Q40 435 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 EHD1Q9H4M9 534 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 XKR8Q9H6D3 395 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PELI2Q9HAT8 420 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 MRGBPQ9NV56 204 aa14.9□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.89□□□□□ -0.03
VAMP1-202ENST00000396308 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.89□□□□□ -0.03
VAMP1-202ENST00000396308 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.89□□□□□ -0.03
VAMP1-202ENST00000396308 ISM1B1AKI9 464 aa14.89□□□□□ -0.03
VAMP1-202ENST00000396308 E7EQ34 232 aa14.89□□□□□ -0.03
VAMP1-202ENST00000396308 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.89□□□□□ -0.03
VAMP1-202ENST00000396308 EBAG9O00559 213 aa14.89□□□□□ -0.03
VAMP1-202ENST00000396308 PPP6CO00743 305 aa14.89□□□□□ -0.03
VAMP1-202ENST00000396308 ZW10O43264 779 aa14.89□□□□□ -0.03
VAMP1-202ENST00000396308 EPN2O95208 641 aa14.89□□□□□ -0.03
VAMP1-202ENST00000396308 JUPP14923 745 aa14.89□□□□□ -0.03
VAMP1-202ENST00000396308 HRH2P25021 359 aa14.89□□□□□ -0.03
VAMP1-202ENST00000396308 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
VAMP1-202ENST00000396308 MPLP40238 635 aa14.89□□□□□ -0.03
VAMP1-202ENST00000396308 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
VAMP1-202ENST00000396308 ABATP80404 500 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms