RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 PQLC1Q8N2U9 271 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 LIX1Q8N485 282 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 SMRP1Q8NCR6 262 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 OR9A1PQ8NGU1 263 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 GANCQ8TET4 914 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 SLC13A3Q8WWT9 602 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 STARD8Q92502 1023 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 FAM131CQ96AQ9 280 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 VPS33AQ96AX1 596 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 RAD51AP1Q96B01 352 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 MSLNLQ96KJ4 702 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 TEX37Q96LM6 180 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 TEX101Q9BY14 249 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 BRF2Q9HAW0 419 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 IL1RL2Q9HB29 575 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 GULP1Q9UBP9 304 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 MAPRE3Q9UPY8 281 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 LRCH1Q9Y2L9 728 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 AP3M1Q9Y2T2 418 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa10.81□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 AQP12BA6NM10 295 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF839A8K0R7 811 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 C9JVG2 144 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 H3BNX3 289 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 KMOO15229 486 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PEX1O43933 1283 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 MYO1DO94832 1006 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 HOXB2P14652 356 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 HSD17B2P37059 387 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 GCGRP47871 477 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 TBPL1P62380 186 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 RHDQ02161 417 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 MAP7Q14244 749 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 INPP5AQ14642 412 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PTGR1Q14914 329 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 DPY19L1Q2PZI1 675 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 WSCD2Q2TBF2 565 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 DOK6Q6PKX4 331 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 LIAT1Q6ZQX7 453 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 HID1Q8IV36 788 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 AQP12AQ8IXF9 295 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 SLC15A3Q8IY34 581 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 RAB42Q8N4Z0 105 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PLA2G15Q8NCC3 412 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 FAM156AQ8NDB6 213 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PHC3Q8NDX5 983 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF480Q8WV37 535 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 DNASE1L2Q92874 299 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 ZUFSPQ96AP4 578 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 SH3GL1Q99961 368 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 SLC39A3Q9BRY0 314 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 EFCAB11Q9BUY7 163 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 KLHL4Q9C0H6 718 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 VCXQ9H320 206 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 EHD1Q9H4M9 534 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 ALG2Q9H553 416 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 ACTL8Q9H568 366 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 RMI1Q9H9A7 625 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PREBQ9HCU5 417 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 FBXL12Q9NXK8 326 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 FZD4Q9ULV1 537 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa10.8□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 KANSL1LA0AUZ9 987 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 ASPDHA6ND91 283 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 E7EQ34 232 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PI15O43692 258 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PRMT3O60678 531 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 KCNJ13O60928 360 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 BCKDHAP12694 445 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 KELP23276 732 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 ACADLP28330 430 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 IL12AP29459 219 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 LTBRP36941 435 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 CLDN8P56748 225 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PHEXP78562 749 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PRR20EP86478 221 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PRR20CP86479 221 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PRR20DP86480 221 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PRR20BP86481 221 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PRR20AP86496 221 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 LAPTM5Q13571 262 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 PWP1Q13610 501 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 DOC2AQ14183 400 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 E2F2Q14209 437 aa10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
CTXN3-202ENST00000395322 NFE2L1Q14494 772 aa10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms