RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 HSPH1Q92598 858 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 C1orf159Q96HA4 380 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 MAGEE1Q9HCI5 957 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 POMT2Q9UKY4 750 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 WDR37Q9Y2I8 494 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 PCSK5Q92824 1860 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 MATN3O15232 486 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 DLX3O60479 287 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ZNF205O95201 554 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 SCG5P05408 212 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 RALBP11234 206 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 SPTBP11277 2137 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CXCR2P25025 360 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 HSD3B2P26439 372 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 MIPP30301 263 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 AKT1P31749 480 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CD96P40200 585 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 LMAN1P49257 510 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 RAB28P51157 221 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 GFRA1P56159 465 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CSNK1G2P78368 415 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 DSC2Q02487 901 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ITGA9Q13797 1035 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 DPYSQ14117 519 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CA9Q16790 459 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 METRNLQ641Q3 311 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ACAD10Q6JQN1 1059 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 SARM1Q6SZW1 724 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 MON1BQ7L1V2 547 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CCNYQ8ND76 341 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 GPR150Q8NGU9 434 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 HAS2Q92819 552 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 NINJ1Q92982 152 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 FKBP10Q96AY3 582 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 DCUN1D1Q96GG9 259 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 VPS35Q96QK1 796 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 WDR24Q96S15 920 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 FOXC2Q99958 501 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 WWP1Q9H0M0 922 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 DUSP13Q9UII6 198 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 SHOC2Q9UQ13 582 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CSAG2Q9Y5P2 127 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 SCINQ9Y6U3 715 aa7.56□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 MGAT4DA6NG13 374 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 PRRG2O14669 202 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 MAP2K7O14733 419 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 AURKAO14965 403 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 PRODHO43272 600 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 PEX11BO96011 259 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CBSLP0DN79 551 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ICAM2P13598 275 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 IFNGR1P15260 489 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ST6GAL1P15907 406 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ABOP16442 354 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CHRNB2P17787 502 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 DNASE1P24855 282 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CCNCP24863 283 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CBSP35520 551 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 PCK1P35558 622 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CD86P42081 329 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 TNFSF10P50591 281 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 KRTAP10-9P60411 292 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 POU4F1Q01851 419 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 TEKQ02763 1124 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 OCA2Q04671 838 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 AP1B1Q10567 949 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 PTP4A2Q12974 167 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 MAMLD1Q13495 774 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 PCOLCEQ15113 449 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 SLC5A12Q1EHB4 618 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 BIVMQ86UB2 503 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ZNF547Q8IVP9 402 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 MAP7D3Q8IWC1 876 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.55□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms