RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.83□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 TLK1Q9UKI8 766 aa14.83□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa14.83□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 E7ENX8 843 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT38O76015 456 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 MT-ND3P03897 115 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM153BP0C7A2 387 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC166P0CW27 439 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 TAP2Q03519 686 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF460Q14592 562 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR19Q15760 415 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM153CQ494X1 144 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 FIGLAQ6QHK4 219 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 FRA10AC1Q70Z53 315 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR135Q8IZ08 494 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2L3Q8NG85 312 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 DLG3Q92796 817 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 MIPEPQ99797 713 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 APMAPQ9HDC9 416 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ACOT9Q9Y305 439 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PPV9 198 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT87PA6NCN2 255 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 KLK10O43240 276 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 RIPK2O43353 540 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 STK17BO94768 372 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGP20916 626 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 HRH2P25021 359 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 IMPA1P29218 277 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 SERPINB8P50452 374 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 PGGT1BP53609 377 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 UCNP55089 124 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ITGA1P56199 1179 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 CDKL1Q00532 357 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP7Q14244 749 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 PHKG1Q16816 387 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 AGTRAPQ6RW13 159 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ESX1Q8N693 406 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXL8Q96CD0 374 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 CRELD1Q96HD1 420 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 PAFAH2Q99487 392 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ACAT2Q9BWD1 397 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 SNX7Q9UNH6 387 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 KLK4Q9Y5K2 254 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A087X1B8 175 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC189A1A4V9 331 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 CDC7O00311 574 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 TUBBP07437 444 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ANXA5P08758 320 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 HBQ1P09105 142 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 TYK2P29597 1187 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 GRIA3P42263 894 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 HNMTP50135 292 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 CSHL1Q14406 222 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ICE2Q659A1 982 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 SBSNQ6UWP8 590 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 DTX1Q86Y01 620 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 IL22RA1Q8N6P7 574 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms