RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSAT1Q9Y617 370 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FASNP49327 2511 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRP2O60462 931 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC16A8O95907 504 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPN1P07384 714 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 HBQ1P09105 142 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FURINP09958 794 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FDXRP22570 491 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPN4P29074 926 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 GCGRP47871 477 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNLIPRP1P54315 467 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 MGAT5Q09328 741 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERV3-1Q14264 604 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 HECTD2Q5U5R9 776 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAQR3Q6TCH7 311 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUSD1Q6UWL2 747 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF843Q8N446 348 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPATCH11Q8N954 259 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF480Q8WV37 535 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMPDL3AQ92484 453 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 DLG3Q92796 817 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC6A20Q9NP91 592 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFATQ9P243 1243 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC23Q9UJX2 597 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 BSNQ9UPA5 3926 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD12Q6UB98 2062 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC14CA4D256 554 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 TARM1B6A8C7 271 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTSVO60911 334 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN12O95859 305 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYF2O95926 243 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 RECKO95980 971 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSD17B2P37059 387 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGS4P49798 205 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGGT1BP53609 377 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLE2P56282 527 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS15P62841 145 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB109BQ30KR1 87 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM45BPQ6NSW5 357 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHBDD2Q6NTF9 364 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLDC1Q6P9B6 456 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPN12Q6ZSI9 719 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPFIBP2Q8ND30 876 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM45AQ8TCE6 357 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZUFSPQ96AP4 578 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINGO1Q96FE5 620 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 GBP5Q96PP8 586 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 OLFM1Q99784 485 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACAT2Q9BWD1 397 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB17Q9H0T7 212 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAYSD1Q9NPB0 183 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRAK4Q9NWZ3 460 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRPK3Q9UPE1 567 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF462Q96JM2 2506 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF839A8K0R7 811 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 E7ENX8 843 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB14O43829 449 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB40ALP0C0E4 278 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 IMPA1P29218 277 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 CMPK1P30085 196 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCR10P46092 362 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAP2Q03519 686 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL10RAQ13651 578 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRADDQ15628 312 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC24Q6UX98 284 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF44Q7L0R7 432 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYVN1Q86TM6 617 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 PROKR1Q8TCW9 393 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 PYROXD1Q8WU10 500 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF285Q96NJ3 590 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM117AQ9C073 453 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMYD2Q9NRG4 433 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENAMQ9NRM1 1142 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAC3Q9UHF0 121 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2A25A4D2G3 310 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 URI1O94763 535 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 C8GP07360 202 aa18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms