RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 XPAP23025 273 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 TMEM259Q4ZIN3 620 aa18.69■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 OR52E4Q8NGH9 312 aa18.69■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 MUS81Q96NY9 551 aa18.69■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 TBC1D14Q9P2M4 693 aa18.69■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 IL36AQ9UHA7 158 aa18.69■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 ARHGEF33A8MVX0 844 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 GNGT2O14610 69 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 TSPAN6O43657 245 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 SLCO2B1O94956 709 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 SERPINA1P01009 418 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 RETP07949 1114 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 GSTM1P09488 218 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 PTPN6P29350 595 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 YAP1P46937 504 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 IRF8Q02556 426 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 GSTM4Q03013 218 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 SYTL3Q4VX76 610 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 OR4F3Q6IEY1 312 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 NOXRED1Q6NXP6 359 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 GPR180Q86V85 440 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 NETO1Q8TDF5 533 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 FOXJ1Q92949 421 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 SMURF2Q9HAU4 748 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 CIDEBQ9UHD4 219 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 NPIPB8E9PQR5 432 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 CD22P20273 847 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 SHMT2P34897 504 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 NNMTP40261 264 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 PREPP48147 710 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 ZNF284Q2VY69 593 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 ZBED5Q49AG3 693 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 XKR6Q5GH73 641 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 RASGRP3Q8IV61 690 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 HS3ST5Q8IZT8 346 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 ZNF366Q8N895 744 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 TIFAQ96CG3 184 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 ZSWIM3Q96MP5 696 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 C11orf49Q9H6J7 331 aa18.68■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 TSPAN11A1L157 253 aa18.67■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 SERTM1A2A2V5 107 aa18.67■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 RFXANKO14593 260 aa18.67■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 PER2O15055 1255 aa18.67■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 HPRP00739 348 aa18.67■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 CTSCP53634 463 aa18.67■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 AP1ARQ63HQ0 302 aa18.67■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.67■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 BTN2A2Q8WVV5 523 aa18.67■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 IRAK3Q9Y616 596 aa18.67■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 E7EQ34 232 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 WNT9AO14904 365 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 KIAA0355O15063 1070 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 ACPPP15309 386 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 KIR3DL1P43629 444 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 ZNF805Q5CZA5 627 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 LIPJQ5W064 366 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 DOK6Q6PKX4 331 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 SYT12Q8IV01 421 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 NELL1Q92832 810 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 MED8Q96G25 268 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 TOR3AQ9H497 397 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 NOBOXO60393 691 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 SYN1P17600 705 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 ELK4P28324 431 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 BDKRB1P46663 353 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 ABHD18Q0P651 414 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 SLC14A1Q13336 389 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 NAE1Q13564 534 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 KCNC3Q14003 757 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 CCSMST1Q4G0I0 132 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 DPPA4Q7L190 304 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 OR7A2PQ8NGA2 310 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 ING5Q8WYH8 240 aa18.66■□□□□ 0.58
USP21-201ENST00000289865 TMEM159Q96B96 161 aa18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms