RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 TSPAN17Q96FV3 270 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PRR23AA6NEV1 266 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PRORSD1PA6NEY8 169 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CLOCKO15516 846 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 DLX3O60479 287 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 NIPSNAP2O75323 286 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ESR1P03372 595 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 NAT1P18440 290 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 HPCAL1P37235 193 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 DGKEP52429 567 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TPTEP56180 551 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PGS1Q32NB8 556 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 GJD3Q8N144 294 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CANT1Q8WVQ1 401 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 NELL2Q99435 816 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 COPS8Q99627 209 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CLPBQ9H078 707 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PARVBQ9HBI1 364 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 VTI1BQ9UEU0 232 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FAM149AA5PLN7 773 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 S100BP04271 92 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 BMP2P12643 396 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TPMTP51580 245 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 MFSD2AQ8NA29 543 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 XPR1Q9UBH6 696 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TRAF6Q9Y4K3 522 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 DOCK9Q9BZ29 2069 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 IQCF5A8MTL0 148 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 MTX2O75431 263 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 RHOBTB1O94844 696 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 DPTQ07507 201 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CLIP3Q96DZ5 547 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 VPS35Q96QK1 796 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF347Q96SE7 839 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 GALPQ9UBC7 116 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ACOT9Q9Y305 439 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FIS1Q9Y3D6 152 aa19.78■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 DNASE1L3Q13609 305 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FGL2Q14314 439 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 SLC36A3Q495N2 470 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM31Q5JXX7 168 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM207Q6UWW9 146 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 BTN2A2Q8WVV5 523 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 GLYATL1Q969I3 302 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 AURKCQ9UQB9 309 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CLDN25C9JDP6 229 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 SLCO1B7G3V0H7 640 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 INPP4BO15327 924 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TPST1O60507 370 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 NSG1P42857 185 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 HK2P52789 917 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TMBIM6P55061 237 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 SELENBP1Q13228 472 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 RAET1GQ6H3X3 334 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ERMP1Q7Z2K6 904 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PJA1Q8NG27 643 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 NXNL1Q96CM4 212 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 HHIPQ96QV1 700 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 GPR21Q99679 349 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FANCEQ9HB96 536 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R13Q9NYV9 303 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 COMMD10Q9Y6G5 202 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 DGKBQ9Y6T7 804 aa19.77■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 A0A087X1B8 175 aa19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD34BA5PLL1 514 aa19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-201ENST00000265339 TARM1B6A8C7 271 aa19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-201ENST00000265339 ATG13O75143 517 aa19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-201ENST00000265339 JRKO75564 520 aa19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-201ENST00000265339 AKT1P31749 480 aa19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-201ENST00000265339 RPS21P63220 83 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF846Q147U1 533 aa19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-201ENST00000265339 EPHX4Q8IUS5 362 aa19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-201ENST00000265339 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-201ENST00000265339 PDPRQ8NCN5 879 aa19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-201ENST00000265339 ABHD11Q8NFV4 315 aa19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-201ENST00000265339 OR13F1Q8NGS4 319 aa19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-201ENST00000265339 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms