RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 IFNGR2P38484 337 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 APLP1P51693 650 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 RPA4Q13156 261 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 TREML2Q5T2D2 321 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 RETSATQ6NUM9 610 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 ISCA2Q86U28 154 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 METTL4Q8N3J2 472 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 TEX47Q8TBZ9 253 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 PIGKQ92643 395 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 INIPQ9NRY2 104 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 J3KR12 359 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 GLUD1P00367 558 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 NR2F1P10589 423 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CDKN2DP55273 166 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 NPRL3Q12980 569 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 BCL7AQ4VC05 210 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 DCST1Q5T197 706 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 ANXA8L1Q5VT79 327 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 NOXA1Q86UR1 476 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 PYCR2Q96C36 320 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 IDNKQ5T6J7 187 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 TLL1O43897 1013 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 OR7A10O76100 309 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 IFNA16P05015 189 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 PRG2P13727 222 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 PUDPQ08623 228 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 SEMA3AQ14563 771 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 NPWQ8N729 165 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 OR5H6Q8NGV6 325 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 OR51E2Q9H255 320 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 GPR83Q9NYM4 423 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CMAHPQ9Y471 501 aa14.73□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 TRAV6A0A075B6T7 132 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 OR4Q2P0C623 313 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CD1DP15813 335 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 RHOQP17081 205 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 GRK4P32298 578 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 PBX3P40426 434 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 SMIM11AP58511 58 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 DEFA5Q01523 94 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 ABRQ12979 859 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 KCNA10Q16322 511 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 TRNP1Q6NT89 227 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 OR7D4Q8NG98 312 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 PPCDCQ96CD2 204 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 MID1O15344 667 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 SEC14L2O76054 403 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CATP04040 527 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 RLN1P04808 185 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 HCAR3P49019 387 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 TAZQ16635 292 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 ASB12Q8WXK4 309 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CTRCQ99895 268 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 NLKQ9UBE8 527 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 MLXQ9UH92 298 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CDH7Q9ULB5 785 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 NRCAMQ92823 1304 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 LCHNA4D1U4 455 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 PDPK1O15530 556 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 SOX14O95416 240 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 GGT1P19440 569 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CHIT1Q13231 466 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CCDC120Q96HB5 630 aa14.72□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms