RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 EGFL7Q9UHF1 273 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 RIMKLBQ9ULI2 386 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR45Q9Y5Y3 372 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0U1RQS6 177 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 UBXN8O00124 270 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 HTR1EP28566 365 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNC1P48547 511 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 AP1S1P61966 158 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 LCP2Q13094 533 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 RCAN2Q14206 197 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 PCSK7Q16549 785 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 MRNIPQ6NTE8 343 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 RGL4Q8IZJ4 473 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 CADM4Q8NFZ8 388 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D15Q8TC07 691 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 GIPC3Q8TF64 312 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 PTERQ96BW5 349 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 ECHDC3Q96DC8 303 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 PHF12Q96QT6 1004 aa25.63■■□□□ 1.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 PARD6AQ9NPB6 346 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 EI24O14681 340 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 WNT9AO14904 365 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 ATE1O95260 518 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 HGFP14210 728 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINA4P29622 427 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 GSK3BP49841 420 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 SPEM2Q0P670 501 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 TCEAL6Q6IPX3 200 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 TCEAL3Q969E4 200 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEE1Q9HCI5 957 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 FSCN3Q9NQT6 498 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 GNPTGQ9UJJ9 305 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC72A6NJI9 287 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 A8MX80 341 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 INPP4BO15327 924 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 EPN2O95208 641 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 INHBBP09529 407 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR35P0CG20 571 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 OGNP20774 298 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 CD86P42081 329 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 C21orf59P57076 290 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 CTBSQ01459 385 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 NFYCQ13952 458 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0895LQ68EN5 471 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF773Q6PK81 442 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD8Q6ZWB6 473 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX31Q8N9S9 440 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf50Q9BV19 199 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 SYTL2Q9HCH5 934 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 DKK3Q9UBP4 350 aa25.62■■□□□ 1.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 PILRBQ9UKJ0 227 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 RAI2Q9Y5P3 530 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 PLXNA2O75051 1894 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM149AA5PLN7 773 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 GFRA3O60609 400 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDH8O95206 1070 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 RETP07949 1114 aa25.61■■□□□ 1.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 KDELC2Q7Z4H8 507 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 TADA1Q96BN2 335 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 RDH12Q96NR8 316 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa25.61■■□□□ 1.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa25.61■■□□□ 1.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 PORP16435 677 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G5P39877 138 aa25.61■■□□□ 1.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 LIPEQ05469 1076 aa25.61■■□□□ 1.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 SFRP1Q8N474 314 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 STAG3L4Q8TBR4 150 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM122AQ96E09 287 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 ATOH8Q96SQ7 321 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 BRINP2Q9C0B6 783 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 AIG1Q9NVV5 245 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
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