RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 FOXA1P55317 472 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 LIPEQ05469 1076 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 DPPA4Q7L190 304 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 LIX1Q8N485 282 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ITFG1Q8TB96 612 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 FIG4Q92562 907 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CNBD2Q96M20 576 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 NECTIN4Q96NY8 510 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM45AQ9NWC5 275 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PRSS21Q9Y6M0 314 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 NUMBLQ9Y6R0 609 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 COL6A6A6NMZ7 2263 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MIA3Q5JRA6 1907 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ERVPABLB-1P60509 514 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PIGGQ5H8A4 983 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CHSY3Q70JA7 882 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MTSS1LQ765P7 747 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CLEC4FQ8N1N0 589 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 KRT78Q8N1N4 520 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 DNAJB8Q8NHS0 232 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 HCAR2Q8TDS4 363 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 RAB7BQ96AH8 199 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 APOLD1Q96LR9 279 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SEPHS2Q99611 448 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SGK2Q9HBY8 427 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MARK1Q9P0L2 795 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CHD8Q9HCK8 2581 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PPP6CO00743 305 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 POU2F2P09086 479 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC159P0C7I6 412 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ZCCHC18P0CG32 403 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 UQCRBP14927 111 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF23P17027 643 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CXCR2P25025 360 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 HNF4AP41235 474 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 UFM1P61960 85 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CEACAM7Q14002 265 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CCNIQ14094 377 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ADGRE1Q14246 886 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 AMZ1Q400G9 498 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PGM2L1Q6PCE3 622 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SLC13A3Q8WWT9 602 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PYCR2Q96C36 320 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 RHBDF1Q96CC6 855 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PPM1MQ96MI6 270 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SLC12A9Q9BXP2 914 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SLC22A14Q9Y267 594 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 RNF11Q9Y3C5 154 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 AQP12BA6NM10 295 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 FAM170BA6NMN3 283 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 GFRA2O00451 464 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 C1SP09871 688 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TIMP2P16035 220 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PEX2P28328 305 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 RPS14P62263 151 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 HMGCS1Q01581 520 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PTSQ03393 145 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 AQP12AQ8IXF9 295 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 RNF145Q96MT1 663 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TSSK3Q96PN8 268 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 BTBD9Q96Q07 612 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PCDHAC1Q9H158 963 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CREBBPQ92793 2442 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SAC3D1A6NKF1 404 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MMP20O60882 483 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 GPIP06744 558 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SLC35G4P0C7Q5 338 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 UMPSP11172 480 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PHKG1Q16816 387 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF423Q2M1K9 1284 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 FRG2Q64ET8 278 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 NEK5Q6P3R8 708 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 HID1Q8IV36 788 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 NELL1Q92832 810 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 C3orf30Q96M34 536 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 FRG2BQ96QU4 278 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 LRRC3Q9BY71 257 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ING2Q9H160 280 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SH3BP4Q9P0V3 963 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TMED5Q9Y3A6 229 aa10.34□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 RTTNQ86VV8 2226 aa10.33□□□□□ -0.76
PRRX1-201ENST00000239461 LRRC72A6NJI9 287 aa10.33□□□□□ -0.76
PRRX1-201ENST00000239461 WASH3PC4AMC7 463 aa10.33□□□□□ -0.76
PRRX1-201ENST00000239461 NUAK1O60285 661 aa10.33□□□□□ -0.76
PRRX1-201ENST00000239461 MAN1A2O60476 641 aa10.33□□□□□ -0.76
PRRX1-201ENST00000239461 EPN2O95208 641 aa10.33□□□□□ -0.76
PRRX1-201ENST00000239461 G6PDP11413 515 aa10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms