RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 PRLHRP49683 370 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 YBX1P67809 324 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 UNC5AQ6ZN44 842 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CAMKMTQ7Z624 323 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS58Q8IYP2 241 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 AMER2Q8N7J2 671 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PLD5Q8N7P1 536 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 KCTD6Q8NC69 237 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 MDS2Q8NDY4 140 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 RAPGEF5Q92565 580 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 KCNJ16Q9NPI9 418 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ENAMQ9NRM1 1142 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 RIC8BQ9NVN3 520 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 LRFN1Q9P244 771 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ADAM21Q9UKJ8 722 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 MAU2Q9Y6X3 613 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 LY6G6DO95868 133 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PCSK6P29122 969 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CD151P48509 253 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 DGKQP52824 942 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF33BQ06732 778 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 NOMO1Q15155 1222 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 SLC18A3Q16572 532 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CEP128Q6ZU80 1094 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 MIEF2Q96C03 454 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 SCMH1Q96GD3 660 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 RNF157Q96PX1 679 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 TRABDQ9H4I3 376 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 COG4Q9H9E3 785 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 MKL2Q9ULH7 1088 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 L3MBTL1Q9Y468 752 aa15.62■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CUBNO60494 3623 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF487B1APH4 448 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 KLK8O60259 260 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 MED26O95402 600 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 H2AFZP0C0S5 128 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 MX2P20592 715 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 MAGP20916 626 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PDHA2P29803 388 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 HOXC12P31275 282 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 SHMT2P34897 504 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PAMR1Q6UXH9 720 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 NAPRTQ6XQN6 538 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 H2AFVQ71UI9 128 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 MAP7D3Q8IWC1 876 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA22Q8NHS9 363 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF285Q96NJ3 590 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CEP41Q9BYV8 373 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A51Q9H1U9 297 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 STMN3Q9NZ72 180 aa15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 FITM1A5D6W6 292 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 TPBGLP0DKB5 382 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 KDELR1P24390 212 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 OCA2Q04671 838 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 GRM7Q14831 915 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 SLC9A4Q6AI14 798 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 LAPTM4BQ86VI4 370 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CCNYQ8ND76 341 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC7Q99615 494 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL1Q9NR64 748 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 RASSF1Q9NS23 344 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 OR6C2Q9NZP2 312 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 EDARQ9UNE0 448 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL20Q9Y2M5 609 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 HRH3Q9Y5N1 445 aa15.6■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 IDSB3KWA1 339 aa15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 BUD23O43709 281 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM253P0C7T8 217 aa15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 TUBA3CQ13748 450 aa15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB113Q30KQ7 82 aa15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CD163Q86VB7 1156 aa15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 VSIG1Q86XK7 387 aa15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 BEST3Q8N1M1 668 aa15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 OR5AR1Q8NGP9 310 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms