RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 MRGPRX1Q96LB2 322 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 FRG2BQ96QU4 278 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CDRT15Q96T59 188 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 EHD1Q9H4M9 534 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ELOVL6Q9H5J4 265 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 LRTM1Q9HBL6 345 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SGK2Q9HBY8 427 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 GID8Q9NWU2 228 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 C1orf109Q9NX04 203 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM181Q9P2C4 612 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 MAP10Q9P2G4 905 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC23A2Q9UGH3 650 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 BCAP29Q9UHQ4 241 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 POMPQ9Y244 141 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TMED5Q9Y3A6 229 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNE2Q9Y6J6 123 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 MYO9BQ13459 2157 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF839A8K0R7 811 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 E7ENX8 843 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIM38O00635 465 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TOR1BO14657 336 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 FFAR3O14843 346 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CLGNO14967 610 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ANGPT2O15123 496 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR42O15529 346 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PI15O43692 258 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PDYNP01213 254 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 IGLV3-19P01714 112 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CEACAM5P06731 702 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ACADMP11310 421 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 G6PDP11413 515 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC2A4P14672 509 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 GNAZP19086 355 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ME2P23368 584 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 HALP42357 657 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNK10P57789 538 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 UFM1P61960 85 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CTBSQ01459 385 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TAP2Q03519 686 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 DOC2AQ14183 400 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TLR1Q15399 786 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 IMPG1Q17R60 797 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 DOK6Q6PKX4 331 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 LPCAT2Q7L5N7 544 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 HPS6Q86YV9 775 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 DPP10Q8N608 796 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PHC3Q8NDX5 983 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 OR2T34Q8NGX1 318 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 OR5K2Q8NHB8 316 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 OR4K3Q96R72 315 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 APOOQ9BUR5 198 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ACPTQ9BZG2 426 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ACTL8Q9H568 366 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SPAG4Q9NPE6 437 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SPATA7Q9P0W8 599 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ABCD2Q9UBJ2 740 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 OR1A2Q9Y585 309 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms