RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 POU6F1Q14863 301 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TCEAL1Q15170 157 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TCTE1Q5JU00 501 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRP9Q7RTR0 991 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 NR4A3Q92570 626 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC22A18Q96BI1 424 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ARNT2Q9HBZ2 717 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PTGFRNQ9P2B2 879 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 FBN2P35556 2912 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PCM1Q15154 2024 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDH17O14917 1159 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ONECUT2O95948 504 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 RBP3P10745 1247 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CARSP49589 748 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 KBTBD2Q8IY47 623 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP61Q8NHU2 1237 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 STYXQ8WUJ0 223 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT35Q92764 455 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 IL17FQ96PD4 163 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 MESP1Q9BRJ9 268 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G3Q9NZ20 509 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 USP1O94782 785 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 MSNP26038 577 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 HTR1EP28566 365 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PTGER4P35408 488 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TDGF1P3P51864 188 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 OCA2Q04671 838 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 FIGLAQ6QHK4 219 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 MRGPRGQ86SM5 289 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01555Q8NAE3 123 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 MIEF2Q96C03 454 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf44Q96CB5 159 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 LURAP1Q96LR2 239 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 SVILO95425 2214 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 POLQO75417 2590 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV17A0A0B4J275 112 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51F1A6NGY5 319 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL21O00585 134 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 S1PR4O95977 384 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 KLC1Q07866 573 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 SF1Q15637 639 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM214AQ32MH5 1076 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM207Q6UWW9 146 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PACS1Q6VY07 963 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 DTWD1Q8N5C7 304 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC120Q96HB5 630 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TAAR6Q96RI8 345 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CHST11Q9NPF2 352 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 C3orf18Q9UK00 162 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 VSTM2BA6NLU5 285 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 UNC5CO95185 931 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 RPN2P04844 631 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CD9P21926 228 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 INAQ16352 499 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 VWA2Q5GFL6 755 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 STT3BQ8TCJ2 826 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF304Q9HCX3 659 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 IGSF5Q9NSI5 407 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC39A10Q9ULF5 831 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM169AQ9Y6X4 670 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 F8W8V4 182 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PJA2O43164 708 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CBFA2T2O43439 604 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 MFAP3LO75121 409 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT38O76015 456 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 F10P00742 488 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPA14Q0VDF9 509 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CNSTQ6PJW8 725 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 SIRT6Q8N6T7 355 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 NUP210LQ5VU65 1888 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 F8P00451 2351 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ZGRF1Q86YA3 2104 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFSF10P50591 281 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 HADHBP55084 474 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 COPS2P61201 443 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 WASHC2DQ5SRD0 308 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 MTFR2Q6P444 385 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC1Q99614 292 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC40Q9H9A6 602 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1I1O60431 355 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ZGLP1P0C6A0 271 aa26.13■■□□□ 1.77
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