RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1B0GUS0	222 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	ILVBL	A1L0T0	632 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	OR6C74	A6NCV1	312 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061		H3BMH7	237 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	HCN1	O60741	890 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC2A3	P11169	496 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	PTPN6	P29350	595 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	MAN2A2	P49641	1150 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	SCNN1B	P51168	640 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	PLGLB1	Q02325	96 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	OCA2	Q04671	838 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	FIGN	Q5HY92	759 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	TRIL	Q7L0X0	811 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	AMER2	Q8N7J2	671 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	ACCS	Q96QU6	501 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	SOX7	Q9BT81	388 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	EXO5	Q9H790	373 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	KCNK13	Q9HB14	408 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	POMT2	Q9UKY4	750 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1B0GVC2	190 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	C5orf63	A6NC05	138 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	MAPK13	O15264	365 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	INSIG1	O15503	277 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	EPPIN	O95925	133 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	IGHG3	P01860	377 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM157B	P0CG42	384 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	GJB2	P29033	226 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	KRT2	P35908	639 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	GMPR	P36959	345 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	ASPA	P45381	313 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	SCTR	P47872	440 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	CYB561	P49447	251 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	GPR85	P60893	370 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	RHOA	P61586	193 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	NCOA4	Q13772	614 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	MCM6	Q14566	821 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	GRM3	Q14832	879 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	INSC	Q1MX18	579 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	BTBD16	Q32M84	506 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	SATL1	Q86VE3	508 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	GPR150	Q8NGU9	434 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	RAB34	Q9BZG1	259 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	LDAH	Q9H6V9	325 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	C12orf49	Q9H741	205 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	DSCR3	O14972	297 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	TMCC1	O94876	653 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	FTCD	O95954	541 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	SOD1	P00441	154 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	OPN1MW	P04001	364 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	CSF1	P09603	554 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	PRTN3	P24158	256 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	HAL	P42357	657 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	ARSF	P54793	590 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	EMP2	P54851	167 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-222	ENST00000626061	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48

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