RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-222ENST00000609232 ACVR1Q04771 509 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 HYAL2Q12891 473 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 CCNIQ14094 377 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 TGFBIQ15582 683 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 WASH2PQ6VEQ5 465 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 PQLC1Q8N2U9 271 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 SARDHQ9UL12 918 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 A0A1W2PP55 124 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 TMEM247A6NEH6 219 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 TSPAN6O43657 245 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 THRAP10827 490 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 G6PDP11413 515 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 ACP5P13686 325 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 POU2F1P14859 743 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 ITGAXP20702 1163 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 POU1F1P28069 291 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 CDH15P55291 814 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 C1orf61Q13536 156 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 ACAP2Q15057 778 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 SLC14A2Q15849 920 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 GALNT5Q7Z7M9 940 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 FNDC8Q8TC99 324 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 NXPE3Q969Y0 559 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 LTB4R2Q9NPC1 389 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 NDUFAF1Q9Y375 327 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 SPAM1P38567 509 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 CTSCP53634 463 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 CLDN2P57739 230 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 TOMM20Q15388 145 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 DUSP6Q16828 381 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 CES5AQ6NT32 575 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 ADIPOR2Q86V24 386 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 ZNF614Q8N883 585 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 OSCP1Q8WVF1 389 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 CCDC126Q96EE4 140 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 THAP11Q96EK4 314 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 ROGDIQ9GZN7 287 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 EPB41L1Q9H4G0 881 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 ZBTB26Q9HCK0 441 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 PCM1Q15154 2024 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-222ENST00000609232 GRID2O43424 1007 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 FZD6O60353 706 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 ULK1O75385 1050 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 SBK3P0C264 359 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 SMIM18P0DKX4 95 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 MAOBP27338 520 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 ESRRGP62508 458 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 RAB30Q15771 203 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 TECRLQ5HYJ1 363 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 TMEM215Q68D42 235 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 SLC15A3Q8IY34 581 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 METTL25Q8N6Q8 603 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 SMYD1Q8NB12 490 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 OR10A6Q8NH74 314 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 RUBCNLQ9H714 662 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 SELENONQ9NZV5 590 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 EPS15L1Q9UBC2 864 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 PTPRSQ13332 1948 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 TMEM114B3SHH9 223 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 TFPTP0C1Z6 253 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 FDXRP22570 491 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 SLC5A2P31639 672 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 PTGER3P43115 390 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-222ENST00000609232 STT3AP46977 705 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms