RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 VRK3Q8IV63 474 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 CNDP1Q96KN2 507 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF285Q96NJ3 590 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 SEMA3GQ9NS98 782 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 DUSP10Q9Y6W6 482 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 FITM1A5D6W6 292 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 BTNL10A8MVZ5 291 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 ZG16O60844 167 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 GPC4O75487 556 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 FKBP9O95302 570 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 GOT2P00505 430 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 STSP08842 583 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 GRIA3P42263 894 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 OR1D4P47884 311 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 Q0VFX4 171 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 CDH17Q12864 832 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 RBBP7Q16576 425 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM214AQ32MH5 1076 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM180AQ6UWF9 173 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 ISLR2Q6UXK2 745 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00523Q86TU6 105 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 DTWD1Q8N5C7 304 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC57Q8N9N7 239 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF214Q8ND24 703 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 ASZ1Q8WWH4 475 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 HDAC10Q969S8 669 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 MARVELD3Q96A59 401 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 VPS50Q96JG6 964 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 IL17FQ96PD4 163 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 TTC1Q99614 292 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 SLX1AQ9BQ83 275 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 SELENOSQ9BQE4 189 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 ENTPD4Q9Y227 616 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 HEATR9A2RTY3 570 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 IQCF5A8MTL0 148 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 TARM1B6A8C7 271 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 RASGRF2O14827 1237 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 CTSVO60911 334 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 SLCO2B1O94956 709 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 MED26O95402 600 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 HPP00738 406 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 APOA4P06727 396 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 PRF1P14222 555 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 ACVR1Q04771 509 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 MFAP5Q13361 173 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 TSTD2Q5T7W7 516 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF534Q76KX8 674 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 BCORP1Q8N888 145 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4L1Q8NH43 312 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC35B2Q8TB61 432 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF778Q96MU6 729 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 LMF1Q96S06 567 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 MESP1Q9BRJ9 268 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 CRB3Q9BUF7 120 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 CARD6Q9BX69 1037 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 TSSK1BQ9BXA7 367 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPY26PQ9H489 355 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 OLAHQ9NV23 265 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms